51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0218 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4705  transcriptional regulator, putative  87.6 
 
 		 503 aa  924    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000799  predicted transcriptional regulator  73.78 
 
 		 467 aa  706    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4239  transcriptional regulator, XRE family  89.74 
 
 		 510 aa  959    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0405  putative HTH-type transcriptional regulator  72.8 
 
 		 504 aa  775    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0652706  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3044  XRE family transcriptional regulator  84.28 
 
 		 513 aa  883    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.439446  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4434  XRE family transcriptional regulator  89.59 
 
 		 509 aa  956    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2004  XRE family transcriptional regulator  81.18 
 
 		 511 aa  883    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.447226  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1608  XRE family transcriptional regulator  84.68 
 
 		 510 aa  907    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.118934 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06696  hypothetical protein  75.06 
 
 		 467 aa  712    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4294  XRE family transcriptional regulator  89.74 
 
 		 510 aa  959    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1178  XRE family transcriptional regulator  73.51 
 
 		 508 aa  795    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0281  hypothetical protein  73.85 
 
 		 505 aa  783    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.985205  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3866  XRE family transcriptional regulator  88.21 
 
 		 509 aa  942    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2560  XRE family transcriptional regulator  74.9 
 
 		 510 aa  798    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0106  XRE family transcriptional regulator  89.78 
 
 		 509 aa  962    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0680  XRE family transcriptional regulator  76.25 
 
 		 504 aa  804    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0218  transciptional regulator  100 
 
 		 508 aa  1063    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3851  XRE family transcriptional regulator  87.77 
 
 		 510 aa  940    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3944  XRE family transcriptional regulator  87.97 
 
 		 510 aa  941    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3903  transcriptional regulator, XRE family protein  84.68 
 
 		 511 aa  914    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0302  DNA-binding transcriptional regulator  68.79 
 
 		 518 aa  739    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4059  XRE family transcriptional regulator  87.55 
 
 		 510 aa  935    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1175  hypothetical protein  79.17 
 
 		 62 aa  85.9  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  22.88 
 
 		 495 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  26.97 
 
 		 505 aa  60.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  23.46 
 
 		 504 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  22.06 
 
 		 481 aa  55.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  27.8 
 
 		 505 aa  54.7  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  39.02 
 
 		 199 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  39.02 
 
 		 199 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  20.48 
 
 		 500 aa  50.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  25.89 
 
 		 488 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  21.16 
 
 		 490 aa  47.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  36.05 
 
 		 200 aa  47.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 199 aa  47  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 199 aa  47  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  23.53 
 
 		 489 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1013  XRE family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 199 aa  47  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 204 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 188 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  24.87 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  20.99 
 
 		 504 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  21.39 
 
 		 503 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  31.51 
 
 		 105 aa  45.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  42.03 
 
 		 404 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  21.03 
 
 		 489 aa  45.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  21.52 
 
 		 476 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2782  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.02 
 
 		 106 aa  43.9  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.821719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>