50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1178 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06696  hypothetical protein  68.72 
 
 		 467 aa  672    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0680  XRE family transcriptional regulator  72.58 
 
 		 504 aa  768    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0302  DNA-binding transcriptional regulator  67.2 
 
 		 518 aa  728    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0106  XRE family transcriptional regulator  75.15 
 
 		 509 aa  816    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2560  XRE family transcriptional regulator  72.08 
 
 		 510 aa  783    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3866  XRE family transcriptional regulator  74.4 
 
 		 509 aa  800    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0281  hypothetical protein  69.7 
 
 		 505 aa  745    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.985205  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1178  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 508 aa  1060    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4294  XRE family transcriptional regulator  74.95 
 
 		 510 aa  816    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4705  transcriptional regulator, putative  75.6 
 
 		 503 aa  809    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1608  XRE family transcriptional regulator  74.36 
 
 		 510 aa  816    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.118934 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2004  XRE family transcriptional regulator  72.76 
 
 		 511 aa  795    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.447226  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4434  XRE family transcriptional regulator  74.8 
 
 		 509 aa  813    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3044  XRE family transcriptional regulator  71.82 
 
 		 513 aa  783    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.439446  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0405  putative HTH-type transcriptional regulator  67.98 
 
 		 504 aa  751    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0652706  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4239  transcriptional regulator, XRE family  75.15 
 
 		 510 aa  817    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000799  predicted transcriptional regulator  69.38 
 
 		 467 aa  674    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4059  XRE family transcriptional regulator  75.2 
 
 		 510 aa  808    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0218  transciptional regulator  73.51 
 
 		 508 aa  795    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3903  transcriptional regulator, XRE family protein  73.76 
 
 		 511 aa  791    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3944  XRE family transcriptional regulator  74.61 
 
 		 510 aa  811    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3851  XRE family transcriptional regulator  74.61 
 
 		 510 aa  811    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1175  hypothetical protein  98 
 
 		 62 aa  106  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 505 aa  57.4  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1013  XRE family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 491 aa  57.4  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  39.19 
 
 		 200 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 		 496 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  21.26 
 
 		 476 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  22.08 
 
 		 488 aa  48.1  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  36.59 
 
 		 199 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  36.59 
 
 		 199 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  21.07 
 
 		 500 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 188 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 105 aa  45.8  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  26 
 
 		 505 aa  45.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  34.88 
 
 		 191 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  36.49 
 
 		 421 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  36.49 
 
 		 421 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  27.41 
 
 		 495 aa  44.7  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  25.74 
 
 		 481 aa  44.3  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 199 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  34.67 
 
 		 180 aa  43.9  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 199 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 199 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  43.5  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  43.5  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  43.5  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>