23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1175 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1175  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1178  XRE family transcriptional regulator  98 
 
 		 508 aa  106  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2004  XRE family transcriptional regulator  83.67 
 
 		 511 aa  92.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.447226  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4294  XRE family transcriptional regulator  83.67 
 
 		 510 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3851  XRE family transcriptional regulator  83.67 
 
 		 510 aa  91.3  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3944  XRE family transcriptional regulator  83.67 
 
 		 510 aa  91.3  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4239  transcriptional regulator, XRE family  83.67 
 
 		 510 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4059  XRE family transcriptional regulator  83.67 
 
 		 510 aa  91.3  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4434  XRE family transcriptional regulator  83.67 
 
 		 509 aa  91.3  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0106  XRE family transcriptional regulator  83.67 
 
 		 509 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4705  transcriptional regulator, putative  81.63 
 
 		 503 aa  90.5  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3866  XRE family transcriptional regulator  83.67 
 
 		 509 aa  90.5  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3044  XRE family transcriptional regulator  79.17 
 
 		 513 aa  87.8  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.439446  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0281  hypothetical protein  77.55 
 
 		 505 aa  87.8  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.985205  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0680  XRE family transcriptional regulator  75 
 
 		 504 aa  87.4  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1608  XRE family transcriptional regulator  82.98 
 
 		 510 aa  87.4  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.118934 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0405  putative HTH-type transcriptional regulator  73.47 
 
 		 504 aa  86.3  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0652706  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0218  transciptional regulator  79.17 
 
 		 508 aa  85.9  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06696  hypothetical protein  75.51 
 
 		 467 aa  85.9  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000799  predicted transcriptional regulator  75.51 
 
 		 467 aa  84.3  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3903  transcriptional regulator, XRE family protein  80.43 
 
 		 511 aa  83.6  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2560  XRE family transcriptional regulator  76.6 
 
 		 510 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0302  DNA-binding transcriptional regulator  78.26 
 
 		 518 aa  79.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>