59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1745 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1745  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 126 aa  248  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000375519  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1263  XRE family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.197496  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1318  transcriptional regulator, XRE family  39.19 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0826  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000131659  unclonable  0.000000470251 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  30.38 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2894  XRE family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  29.46 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0148  transcriptional regulator, XRE family  39.53 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  27.36 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 277 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0650  transcriptional regulator, XRE family  33.02 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2824  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3114  XRE family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2077  hypothetical protein  26.58 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1998  hypothetical protein  26.58 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.846621  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3488  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2077  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1868  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1992  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0038  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 325 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0067  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 233 aa  45.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3236  transcriptional regulator, XRE family  29.76 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355166  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2601  putative transcriptional regulator  32.39 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0680466  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 140 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0843  XRE family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 130 aa  43.5  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1750  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00805015  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  35.59 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  39.66 
 
 		 141 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 170 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  36.21 
 
 		 156 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 182 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2614  XRE family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 127 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.105443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2662  XRE family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 128 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2854  XRE family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770075  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5660  XRE family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 490 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176576  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 165 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  33.9 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1744  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 235 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.571892  normal  0.738269 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0407  transcriptional regulator  36.17 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  31.18 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2432  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 73 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 175 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  24.71 
 
 		 307 aa  40.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>