36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_0300 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_0300  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
146 aa  296  5e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.223259  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  33.58 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  42.71 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  38.81 
 
 
436 aa  53.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  29.29 
 
 
206 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  29.84 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  36.36 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  49.15 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  50.88 
 
 
163 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 
371 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0962  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0119843  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1750  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00805015  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  37.33 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1142  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000709447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0890  XRE family transcriptional regulator  39.74 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0379  transcriptional regulator  41.79 
 
 
184 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.808324 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  34.02 
 
 
410 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  39.13 
 
 
140 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  37.14 
 
 
156 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0766  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 
183 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3869  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 
183 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  36.25 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0372  transcriptional regulator, XRE family  28.95 
 
 
209 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00901848  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  33.98 
 
 
182 aa  41.2  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0364  phage repressor  35.56 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 
176 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 
161 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 
161 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 
161 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 
277 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  30.21 
 
 
184 aa  40  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 
128 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>