35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_4609 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_4609  transcriptional regulator  100 
 
 		 115 aa  234  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.273253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4589  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 115 aa  234  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4613  helix-turn-helix domain-containing protein  68.18 
 
 		 113 aa  159  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4592  helix-turn-helix domain protein  68.18 
 
 		 113 aa  159  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0851  transcriptional regulator  45.95 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.36492e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0482  XRE family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 125 aa  88.2  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0889934  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0847  hypothetical protein  45 
 
 		 104 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2601  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0680466  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0148  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 477 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  42.86 
 
 		 476 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 477 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2894  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1158  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  37.29 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5384  XRE family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  normal  0.424249 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 256 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 477 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1326  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  37.93 
 
 		 309 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783299  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1223  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  37.93 
 
 		 316 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117145  normal  0.0124179 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4807  XRE family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 185 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0803  XRE family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 185 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4902  XRE family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 185 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.634753 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3464  XRE family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 185 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2408  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 129 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0754748  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4279  XRE family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2858  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 215 aa  40.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000622832  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1318  transcriptional regulator, XRE family  54.05 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2810  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143995  hitchhiker  0.0000258946 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1462  transcriptional regulator, XRE family  35.85 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  35.59 
 
 		 196 aa  40  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0826  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 96 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000131659  unclonable  0.000000470251 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 196 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>