148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2408 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2408  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 129 aa  255  2e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0754748  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0734  transcriptional regulator, XRE family  40.18 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0841  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000196105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3250  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.59 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.653673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28910  Helix-turn-helix protein  37.5 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.38358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  35.94 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 204 aa  48.9  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  32.86 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  34.29 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  40 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3469  DNA-binding protein  33.9 
 
 		 189 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0941  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.551097  normal  0.0671843 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0843  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421262 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  31.65 
 
 		 297 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0965  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476266  normal  0.0356883 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1816  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00473491  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  36.36 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1992  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.979113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1986  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl067  Cro/CI family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3681  transcriptional regulator, XRE family  25.49 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 286 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  32.1 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0075  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  35.38 
 
 		 304 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1080  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0645  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000232876  normal  0.586198 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 259 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3030  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 259 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3049  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 259 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 191 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  33.8 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 194 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  25.69 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05910  predicted transcriptional regulator  31.34 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.848221  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0687  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 105 aa  42.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0236581  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  37.93 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  32.79 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0273  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0791  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 214 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3602  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 488 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3508  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510026 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  37.93 
 
 		 192 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 72 aa  42.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 513 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1855  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0873  DNA-binding protein, putative  28 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.99 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0715  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46710  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0037508  decreased coverage  0.000000167672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6981  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 245 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  38.18 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 488 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3529  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 200 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.295271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  36 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4024  putative transcriptional regulator  32.76 
 
 		 195 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0668  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5273  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  36.23 
 
 		 305 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0340  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4609  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 115 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.273253  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2326  hypothetical protein  36.92 
 
 		 87 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5158  transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 		 198 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 205 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 252 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0675  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  29.35 
 
 		 197 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 211 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 120 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>