22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28910 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28910  Helix-turn-helix protein  100 
 
 		 154 aa  303  4.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.38358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1035  transcriptional regulator, XRE family  56.58 
 
 		 159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2408  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0754748  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 308 aa  45.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0924  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  46.03 
 
 		 323 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325541  normal  0.296459 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4910  transcriptional regulator, XRE family  29.01 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0508  transcriptional regulator, putative  34.92 
 
 		 312 aa  43.9  0.0008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1223  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  33.33 
 
 		 316 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117145  normal  0.0124179 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4238  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0673449  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3148  transcriptional regulator, XRE family  27.03 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 195 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0731  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  46.3 
 
 		 315 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2806  putative transcriptional regulatory protein  40 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1326  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  34.21 
 
 		 309 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783299  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  42.59 
 
 		 302 aa  41.2  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2207  diguanylate cyclase  37.86 
 
 		 735 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4600  helix-turn-helix domain-containing protein  34.62 
 
 		 176 aa  41.2  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 75 aa  41.2  0.006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2305  XRE family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0230  DNA-binding protein  26.87 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0592162  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2325  helix-turn-helix domain-containing protein  35.21 
 
 		 89 aa  40.4  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>