31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3148 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3148  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 168 aa  335  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1851  helix-turn-helix domain-containing protein  73.42 
 
 		 162 aa  238  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1844  XRE family transcriptional regulator  73.42 
 
 		 162 aa  236  8e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1704  XRE family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 165 aa  181  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5247  transcriptional regulator, XRE family  61.33 
 
 		 162 aa  181  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.819669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2795  putative transcriptional regulator, XRE family  61.04 
 
 		 164 aa  180  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3204  XRE family transcriptional regulator  62 
 
 		 165 aa  180  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3017  transcriptional regulator, XRE family  62 
 
 		 164 aa  179  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15530  Helix-turn-helix protein  60 
 
 		 162 aa  179  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.767389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3107  transcriptional regulator, XRE family  60 
 
 		 164 aa  178  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1303  XRE family transcriptional regulator  63.33 
 
 		 163 aa  178  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0137454 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1350  XRE family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 165 aa  176  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316988 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1052  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  58 
 
 		 165 aa  174  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0559159  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3007  transcriptional regulator, XRE family  58.86 
 
 		 164 aa  173  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4281  transcriptional regulator, XRE family  58.49 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3138  helix-turn-helix domain protein  58.55 
 
 		 183 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0455565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2399  helix-turn-helix domain protein  53.8 
 
 		 184 aa  164  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0774  XRE family transcriptional regulator  54.67 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5831  XRE family transcriptional regulator  54 
 
 		 165 aa  148  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2773  XRE family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1697  XRE family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 171 aa  130  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.312098  hitchhiker  0.00643035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3078  XRE family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 176 aa  127  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2559  XRE family transcriptional regulator  46.54 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1291  helix-turn-helix domain protein  33.89 
 
 		 194 aa  97.4  8e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0991344  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2081  XRE family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1656  XRE family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.45225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1035  transcriptional regulator, XRE family  26 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0278  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28910  Helix-turn-helix protein  27.03 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.38358 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  35.94 
 
 		 75 aa  42.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2924  XRE family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 204 aa  41.6  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.705469  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>