28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4281 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4281  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 161 aa  321  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1350  XRE family transcriptional regulator  76.47 
 
 		 165 aa  239  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3017  transcriptional regulator, XRE family  77.12 
 
 		 164 aa  238  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5247  transcriptional regulator, XRE family  76.16 
 
 		 162 aa  237  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.819669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2795  putative transcriptional regulator, XRE family  75.82 
 
 		 164 aa  234  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15530  Helix-turn-helix protein  74.83 
 
 		 162 aa  234  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.767389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1704  XRE family transcriptional regulator  76 
 
 		 165 aa  231  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3107  transcriptional regulator, XRE family  73.2 
 
 		 164 aa  231  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3204  XRE family transcriptional regulator  75.33 
 
 		 165 aa  230  7.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1052  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  74 
 
 		 165 aa  229  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0559159  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1303  XRE family transcriptional regulator  73.51 
 
 		 163 aa  227  4e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0137454 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3007  transcriptional regulator, XRE family  69.68 
 
 		 164 aa  224  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3138  helix-turn-helix domain protein  67.09 
 
 		 183 aa  220  7e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0455565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2399  helix-turn-helix domain protein  66.04 
 
 		 184 aa  205  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1851  helix-turn-helix domain-containing protein  62.58 
 
 		 162 aa  191  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1844  XRE family transcriptional regulator  62.58 
 
 		 162 aa  191  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3148  transcriptional regulator, XRE family  58.49 
 
 		 168 aa  172  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0774  XRE family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 167 aa  164  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5831  XRE family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2773  XRE family transcriptional regulator  55.03 
 
 		 171 aa  153  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2559  XRE family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 176 aa  152  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3078  XRE family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 176 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1697  XRE family transcriptional regulator  51.25 
 
 		 171 aa  148  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.312098  hitchhiker  0.00643035 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1656  XRE family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.45225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2081  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1291  helix-turn-helix domain protein  35.56 
 
 		 194 aa  102  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0991344  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1035  transcriptional regulator, XRE family  25.17 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  33.71 
 
 		 283 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>