30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3204 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3204  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  328  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1704  XRE family transcriptional regulator  96.95 
 
 		 165 aa  319  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1350  XRE family transcriptional regulator  79.87 
 
 		 165 aa  256  9e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3017  transcriptional regulator, XRE family  80.52 
 
 		 164 aa  256  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2795  putative transcriptional regulator, XRE family  79.22 
 
 		 164 aa  253  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527164  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3107  transcriptional regulator, XRE family  77.92 
 
 		 164 aa  251  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1052  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  78.57 
 
 		 165 aa  251  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0559159  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1303  XRE family transcriptional regulator  78.71 
 
 		 163 aa  248  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0137454 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5247  transcriptional regulator, XRE family  76.77 
 
 		 162 aa  243  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.819669  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15530  Helix-turn-helix protein  76.13 
 
 		 162 aa  241  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.767389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3007  transcriptional regulator, XRE family  73.38 
 
 		 164 aa  233  9e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4281  transcriptional regulator, XRE family  75.33 
 
 		 161 aa  230  7.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3138  helix-turn-helix domain protein  71.24 
 
 		 183 aa  225  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0455565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2399  helix-turn-helix domain protein  70.13 
 
 		 184 aa  218  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1851  helix-turn-helix domain-containing protein  70.2 
 
 		 162 aa  199  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1844  XRE family transcriptional regulator  70.2 
 
 		 162 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0774  XRE family transcriptional regulator  60 
 
 		 167 aa  183  8e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3148  transcriptional regulator, XRE family  62 
 
 		 168 aa  180  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5831  XRE family transcriptional regulator  58 
 
 		 165 aa  178  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2773  XRE family transcriptional regulator  55.63 
 
 		 171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3078  XRE family transcriptional regulator  54.97 
 
 		 176 aa  159  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2559  XRE family transcriptional regulator  54.3 
 
 		 176 aa  158  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1697  XRE family transcriptional regulator  54.3 
 
 		 171 aa  156  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.312098  hitchhiker  0.00643035 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1656  XRE family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 185 aa  123  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.45225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2081  XRE family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 179 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1291  helix-turn-helix domain protein  35 
 
 		 194 aa  98.6  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0991344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  35.37 
 
 		 283 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7277  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 189 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  31.5 
 
 		 194 aa  41.2  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0045  PbsX family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 117 aa  40.8  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>