31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2081 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2081  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  338  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1656  XRE family transcriptional regulator  91.01 
 
 		 185 aa  283  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.45225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1350  XRE family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3017  transcriptional regulator, XRE family  45.7 
 
 		 164 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3204  XRE family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3107  transcriptional regulator, XRE family  44.37 
 
 		 164 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1052  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  44.16 
 
 		 165 aa  129  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0559159  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1704  XRE family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 165 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4281  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5247  transcriptional regulator, XRE family  43.71 
 
 		 162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.819669  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15530  Helix-turn-helix protein  43.05 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.767389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1303  XRE family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0137454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2795  putative transcriptional regulator, XRE family  44.37 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3138  helix-turn-helix domain protein  40.91 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0455565  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3007  transcriptional regulator, XRE family  42.38 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5831  XRE family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0774  XRE family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 167 aa  117  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2399  helix-turn-helix domain protein  41.83 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3078  XRE family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 176 aa  104  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2773  XRE family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1851  helix-turn-helix domain-containing protein  39.47 
 
 		 162 aa  101  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1844  XRE family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 162 aa  101  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2559  XRE family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 176 aa  98.2  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1697  XRE family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 171 aa  95.9  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.312098  hitchhiker  0.00643035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3148  transcriptional regulator, XRE family  37.42 
 
 		 168 aa  92.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470504 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1291  helix-turn-helix domain protein  31.28 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0991344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  37.5 
 
 		 283 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1035  transcriptional regulator, XRE family  33.02 
 
 		 159 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 410 aa  42  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  25.73 
 
 		 505 aa  41.2  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>