28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2399 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2399  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 184 aa  370  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1052  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  69.62 
 
 		 165 aa  221  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0559159  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3017  transcriptional regulator, XRE family  69.38 
 
 		 164 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3204  XRE family transcriptional regulator  70.13 
 
 		 165 aa  218  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1704  XRE family transcriptional regulator  70.13 
 
 		 165 aa  217  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3107  transcriptional regulator, XRE family  67.5 
 
 		 164 aa  217  7e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1350  XRE family transcriptional regulator  67.09 
 
 		 165 aa  216  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2795  putative transcriptional regulator, XRE family  68.12 
 
 		 164 aa  216  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3138  helix-turn-helix domain protein  67.31 
 
 		 183 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0455565  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15530  Helix-turn-helix protein  66.05 
 
 		 162 aa  212  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.767389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5247  transcriptional regulator, XRE family  65.43 
 
 		 162 aa  212  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.819669  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1303  XRE family transcriptional regulator  66.46 
 
 		 163 aa  211  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0137454 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3007  transcriptional regulator, XRE family  65.62 
 
 		 164 aa  210  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4281  transcriptional regulator, XRE family  66.04 
 
 		 161 aa  205  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1851  helix-turn-helix domain-containing protein  61.29 
 
 		 162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1844  XRE family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 162 aa  182  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3148  transcriptional regulator, XRE family  53.8 
 
 		 168 aa  164  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2559  XRE family transcriptional regulator  53.29 
 
 		 176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1697  XRE family transcriptional regulator  52.23 
 
 		 171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.312098  hitchhiker  0.00643035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3078  XRE family transcriptional regulator  53.29 
 
 		 176 aa  162  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0774  XRE family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 167 aa  158  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2773  XRE family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 171 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5831  XRE family transcriptional regulator  53.25 
 
 		 165 aa  155  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1291  helix-turn-helix domain protein  39.88 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0991344  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1656  XRE family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 185 aa  100  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.45225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2081  XRE family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 179 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1035  transcriptional regulator, XRE family  25.17 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 194 aa  41.2  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>