27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1291 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1291  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 194 aa  377  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0991344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2399  helix-turn-helix domain protein  39.88 
 
 		 184 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3138  helix-turn-helix domain protein  35.16 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0455565  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2773  XRE family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 171 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1851  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1844  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 162 aa  102  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4281  transcriptional regulator, XRE family  35.56 
 
 		 161 aa  102  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3107  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3204  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 165 aa  98.6  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1303  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 163 aa  98.2  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0137454 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5247  transcriptional regulator, XRE family  34.44 
 
 		 162 aa  98.2  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.819669  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1704  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 165 aa  98.2  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1052  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.11 
 
 		 165 aa  97.8  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0559159  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3017  transcriptional regulator, XRE family  35.56 
 
 		 164 aa  97.8  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15530  Helix-turn-helix protein  34.44 
 
 		 162 aa  97.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.767389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2795  putative transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 164 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3148  transcriptional regulator, XRE family  33.89 
 
 		 168 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470504 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1350  XRE family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 165 aa  96.7  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316988 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3007  transcriptional regulator, XRE family  32.78 
 
 		 164 aa  93.2  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3078  XRE family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 176 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1697  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.312098  hitchhiker  0.00643035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2559  XRE family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 176 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0774  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 167 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5831  XRE family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2081  XRE family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1656  XRE family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.45225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0078  hypothetical protein  40.58 
 
 		 73 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>