29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1851 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1851  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 162 aa  322  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1844  XRE family transcriptional regulator  99.38 
 
 		 162 aa  320  6e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3148  transcriptional regulator, XRE family  73.42 
 
 		 168 aa  238  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2795  putative transcriptional regulator, XRE family  69.81 
 
 		 164 aa  208  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3017  transcriptional regulator, XRE family  68.55 
 
 		 164 aa  205  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3107  transcriptional regulator, XRE family  67.92 
 
 		 164 aa  204  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1350  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 165 aa  201  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316988 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15530  Helix-turn-helix protein  66.88 
 
 		 162 aa  201  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.767389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5247  transcriptional regulator, XRE family  66.24 
 
 		 162 aa  201  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.819669  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1704  XRE family transcriptional regulator  70.2 
 
 		 165 aa  200  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3204  XRE family transcriptional regulator  70.2 
 
 		 165 aa  199  9e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1303  XRE family transcriptional regulator  68.15 
 
 		 163 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0137454 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3007  transcriptional regulator, XRE family  65.19 
 
 		 164 aa  197  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1052  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  65.19 
 
 		 165 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0559159  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4281  transcriptional regulator, XRE family  62.58 
 
 		 161 aa  191  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3138  helix-turn-helix domain protein  65.81 
 
 		 183 aa  189  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0455565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2399  helix-turn-helix domain protein  61.29 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0774  XRE family transcriptional regulator  56.21 
 
 		 167 aa  159  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5831  XRE family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1697  XRE family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.312098  hitchhiker  0.00643035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2773  XRE family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2559  XRE family transcriptional regulator  48.43 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3078  XRE family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 176 aa  130  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1291  helix-turn-helix domain protein  35.29 
 
 		 194 aa  102  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0991344  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1656  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 185 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.45225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2081  XRE family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 179 aa  91.3  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  34.78 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  30.77 
 
 		 200 aa  41.6  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0031  transcriptional regulator, MerR family  30.38 
 
 		 211 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.60803e-35  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>