28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3007 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3007  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 164 aa  329  9e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1303  XRE family transcriptional regulator  75.62 
 
 		 163 aa  252  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0137454 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3017  transcriptional regulator, XRE family  75.31 
 
 		 164 aa  245  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2795  putative transcriptional regulator, XRE family  74.69 
 
 		 164 aa  242  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527164  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3107  transcriptional regulator, XRE family  73.46 
 
 		 164 aa  241  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1350  XRE family transcriptional regulator  71.6 
 
 		 165 aa  237  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316988 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1052  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  73.12 
 
 		 165 aa  237  5.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0559159  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3204  XRE family transcriptional regulator  73.38 
 
 		 165 aa  233  9e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1704  XRE family transcriptional regulator  73.38 
 
 		 165 aa  233  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5247  transcriptional regulator, XRE family  69.81 
 
 		 162 aa  228  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.819669  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15530  Helix-turn-helix protein  68.75 
 
 		 162 aa  227  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.767389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4281  transcriptional regulator, XRE family  69.68 
 
 		 161 aa  224  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3138  helix-turn-helix domain protein  64.63 
 
 		 183 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0455565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2399  helix-turn-helix domain protein  65.62 
 
 		 184 aa  210  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1851  helix-turn-helix domain-containing protein  65.19 
 
 		 162 aa  197  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1844  XRE family transcriptional regulator  65.19 
 
 		 162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3148  transcriptional regulator, XRE family  58.86 
 
 		 168 aa  173  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0774  XRE family transcriptional regulator  54.25 
 
 		 167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5831  XRE family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2559  XRE family transcriptional regulator  54.67 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3078  XRE family transcriptional regulator  54.67 
 
 		 176 aa  154  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1697  XRE family transcriptional regulator  54.67 
 
 		 171 aa  152  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.312098  hitchhiker  0.00643035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2773  XRE family transcriptional regulator  55.33 
 
 		 171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1656  XRE family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 185 aa  113  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.45225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2081  XRE family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 179 aa  110  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1291  helix-turn-helix domain protein  32.78 
 
 		 194 aa  93.2  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0991344  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1663  DNA-binding protein  34.29 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1035  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 159 aa  42  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>