32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1052 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1052  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  100 
 
 		 165 aa  331  3e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0559159  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3107  transcriptional regulator, XRE family  91.41 
 
 		 164 aa  304  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3017  transcriptional regulator, XRE family  90.18 
 
 		 164 aa  300  7.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2795  putative transcriptional regulator, XRE family  89.57 
 
 		 164 aa  297  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527164  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1350  XRE family transcriptional regulator  87.65 
 
 		 165 aa  290  6e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316988 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3204  XRE family transcriptional regulator  78.57 
 
 		 165 aa  251  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1704  XRE family transcriptional regulator  78.57 
 
 		 165 aa  249  8.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1303  XRE family transcriptional regulator  75.93 
 
 		 163 aa  248  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0137454 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5247  transcriptional regulator, XRE family  77.42 
 
 		 162 aa  243  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.819669  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15530  Helix-turn-helix protein  75.47 
 
 		 162 aa  241  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.767389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3007  transcriptional regulator, XRE family  73.12 
 
 		 164 aa  237  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4281  transcriptional regulator, XRE family  74 
 
 		 161 aa  229  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2399  helix-turn-helix domain protein  69.62 
 
 		 184 aa  221  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3138  helix-turn-helix domain protein  67.97 
 
 		 183 aa  214  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0455565  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1851  helix-turn-helix domain-containing protein  65.19 
 
 		 162 aa  195  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1844  XRE family transcriptional regulator  65.19 
 
 		 162 aa  194  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3148  transcriptional regulator, XRE family  58 
 
 		 168 aa  174  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0774  XRE family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 167 aa  174  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5831  XRE family transcriptional regulator  54.97 
 
 		 165 aa  169  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2773  XRE family transcriptional regulator  56.49 
 
 		 171 aa  166  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1697  XRE family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 171 aa  158  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.312098  hitchhiker  0.00643035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2559  XRE family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3078  XRE family transcriptional regulator  52.98 
 
 		 176 aa  153  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1656  XRE family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.45225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2081  XRE family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 179 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1291  helix-turn-helix domain protein  36.11 
 
 		 194 aa  97.8  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0991344  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  28.04 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  31.25 
 
 		 283 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7277  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 189 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  33.77 
 
 		 195 aa  42  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  34.33 
 
 		 69 aa  42  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 81 aa  40.8  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>