27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_15530 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_15530  Helix-turn-helix protein  100 
 
 		 162 aa  323  9e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.767389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5247  transcriptional regulator, XRE family  96.91 
 
 		 162 aa  315  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.819669  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1350  XRE family transcriptional regulator  79.25 
 
 		 165 aa  253  6e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3017  transcriptional regulator, XRE family  79.87 
 
 		 164 aa  252  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2795  putative transcriptional regulator, XRE family  79.25 
 
 		 164 aa  248  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527164  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3107  transcriptional regulator, XRE family  78.06 
 
 		 164 aa  247  5e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1052  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  75.47 
 
 		 165 aa  241  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0559159  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3204  XRE family transcriptional regulator  76.13 
 
 		 165 aa  241  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1704  XRE family transcriptional regulator  76.13 
 
 		 165 aa  239  7.999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1303  XRE family transcriptional regulator  73.25 
 
 		 163 aa  235  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0137454 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4281  transcriptional regulator, XRE family  74.83 
 
 		 161 aa  234  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3138  helix-turn-helix domain protein  75 
 
 		 183 aa  230  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0455565  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3007  transcriptional regulator, XRE family  68.75 
 
 		 164 aa  227  6e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2399  helix-turn-helix domain protein  66.05 
 
 		 184 aa  212  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1851  helix-turn-helix domain-containing protein  66.88 
 
 		 162 aa  201  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1844  XRE family transcriptional regulator  66.88 
 
 		 162 aa  200  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3148  transcriptional regulator, XRE family  60 
 
 		 168 aa  179  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0774  XRE family transcriptional regulator  56.95 
 
 		 167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5831  XRE family transcriptional regulator  54.66 
 
 		 165 aa  162  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2773  XRE family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 171 aa  159  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3078  XRE family transcriptional regulator  52.98 
 
 		 176 aa  158  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2559  XRE family transcriptional regulator  53.29 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1697  XRE family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 171 aa  154  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.312098  hitchhiker  0.00643035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2081  XRE family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1656  XRE family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 185 aa  114  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.45225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1291  helix-turn-helix domain protein  34.44 
 
 		 194 aa  97.4  8e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0991344  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1035  transcriptional regulator, XRE family  25.87 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>