27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1697 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1697  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 171 aa  337  5e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.312098  hitchhiker  0.00643035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3078  XRE family transcriptional regulator  84.12 
 
 		 176 aa  282  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2559  XRE family transcriptional regulator  82.94 
 
 		 176 aa  278  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2773  XRE family transcriptional regulator  79.41 
 
 		 171 aa  262  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0774  XRE family transcriptional regulator  61.69 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5831  XRE family transcriptional regulator  60.65 
 
 		 165 aa  171  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1350  XRE family transcriptional regulator  55.84 
 
 		 165 aa  167  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3017  transcriptional regulator, XRE family  57.14 
 
 		 164 aa  166  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2795  putative transcriptional regulator, XRE family  56.49 
 
 		 164 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527164  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3107  transcriptional regulator, XRE family  56.49 
 
 		 164 aa  164  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2399  helix-turn-helix domain protein  52.23 
 
 		 184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1704  XRE family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 165 aa  158  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1052  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  54.55 
 
 		 165 aa  158  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0559159  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3138  helix-turn-helix domain protein  52.98 
 
 		 183 aa  158  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0455565  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3204  XRE family transcriptional regulator  54.3 
 
 		 165 aa  156  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1303  XRE family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 163 aa  154  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0137454 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15530  Helix-turn-helix protein  52.29 
 
 		 162 aa  154  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.767389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5247  transcriptional regulator, XRE family  51.88 
 
 		 162 aa  154  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.819669  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3007  transcriptional regulator, XRE family  54.67 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4281  transcriptional regulator, XRE family  51.25 
 
 		 161 aa  148  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1851  helix-turn-helix domain-containing protein  52.29 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1844  XRE family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3148  transcriptional regulator, XRE family  48.1 
 
 		 168 aa  130  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470504 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1291  helix-turn-helix domain protein  35 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0991344  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1656  XRE family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 185 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.45225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2081  XRE family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1035  transcriptional regulator, XRE family  30.28 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>