123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_E0031 on replicon NC_011656
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011656  BCAH187_E0031  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 211 aa  420  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.60803e-35  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  38.03 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  38.03 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 123 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 75 aa  53.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 75 aa  53.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 75 aa  53.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 163 aa  53.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  27.35 
 
 		 114 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  27.35 
 
 		 114 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 142 aa  52  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 143 aa  51.6  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 113 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2448  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000416057  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  36.07 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  46.67 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0054  prophage repressor protein  27.19 
 
 		 114 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.515617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 374 aa  49.3  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 281 aa  49.3  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 380 aa  48.9  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 137 aa  48.5  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4414  immunity repressor protein  32.32 
 
 		 139 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  34.44 
 
 		 321 aa  48.5  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 		 135 aa  48.1  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  27.34 
 
 		 137 aa  48.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  40 
 
 		 146 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  34.25 
 
 		 338 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3951  helix-turn-helix domain protein  25 
 
 		 113 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211982 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1931  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  31.88 
 
 		 352 aa  47.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.584244  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 118 aa  47  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  37.29 
 
 		 123 aa  47  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  32.79 
 
 		 369 aa  46.6  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  30.26 
 
 		 374 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  30.26 
 
 		 374 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  30.26 
 
 		 374 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 115 aa  46.6  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4032  prophage LambdaBa02, repressor protein  37.5 
 
 		 114 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00194689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  30.26 
 
 		 374 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 128 aa  46.2  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 383 aa  45.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  30.26 
 
 		 374 aa  46.2  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 115 aa  45.8  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 115 aa  45.8  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  32.81 
 
 		 186 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  30.26 
 
 		 374 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  37.29 
 
 		 125 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  37.29 
 
 		 125 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 368 aa  45.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  27.33 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  30.26 
 
 		 374 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  27.16 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0068  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 87 aa  45.1  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 145 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3849  transcriptional regulator, XRE family  31.51 
 
 		 87 aa  45.1  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0299228  normal  0.323457 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  37.68 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0418  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  30.63 
 
 		 113 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00527482  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  37.29 
 
 		 125 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  37.29 
 
 		 125 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  37.29 
 
 		 125 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0432  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  30.63 
 
 		 113 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000371645  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  37.29 
 
 		 125 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  31.37 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1480  XRE family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 276 aa  44.3  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  37.29 
 
 		 125 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  37.29 
 
 		 125 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 258 aa  44.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3286  DNA-binding protein  31.82 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 134 aa  43.5  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  40.32 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  40.32 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1172  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 372 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.38155 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 104 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 108 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4773  transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0282623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 67 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 152 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 72 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  32.79 
 
 		 181 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 370 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  29.85 
 
 		 140 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 181 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 108 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 142 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  32.31 
 
 		 436 aa  42.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  32.79 
 
 		 95 aa  42.7  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 320 aa  42.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 110 aa  42.7  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  30.26 
 
 		 374 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0079  DNA-binding protein  33.87 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 145 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 115 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>