107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0841 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0841  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 129 aa  254  3e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000196105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2408  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0754748  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  39.71 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2012  DNA-binding protein  47.27 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  32.56 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  32.56 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  32.56 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5877  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00666894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  33.66 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2793  transcriptional regulator, XRE family  37.66 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 90 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4456  transcriptional regulator, XRE family  36.25 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  32.17 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 204 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1485  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4035  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 326 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808008  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2009  DNA-binding protein  42.59 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1786  transcriptional regulator, XRE family  34.57 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.365144  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.07 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 73 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1868  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1992  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2077  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2373  XRE family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  30.93 
 
 		 181 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0734  transcriptional regulator, XRE family  31.43 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  29.35 
 
 		 181 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  29.35 
 
 		 181 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  29.35 
 
 		 181 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3477  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 737 aa  43.5  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552103  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  29.49 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.39 
 
 		 225 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  29.49 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  33.85 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  36.62 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  29.49 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  29.49 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  29.49 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  29.49 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  29.35 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  28.26 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.33 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1652  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000422118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  28.26 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17240  predicted transcriptional regulator  35.53 
 
 		 242 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  40.62 
 
 		 202 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4828  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0026  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.153059  normal  0.660956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3790  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021488 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 281 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 230 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4694  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 224 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1020  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 149 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.638142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2402  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.314707  normal  0.620084 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1027  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 223 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 333 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4441  transcriptional regulator, XRE family  30.14 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 333 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2356  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.190302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 513 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  32.47 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0687  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 105 aa  40.4  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0236581  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  32.47 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1228  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 85 aa  40.4  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0459  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.995488  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  40.3 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  40.3 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1469  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.978322 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0329  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 171 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.846996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  40.3 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  40.3 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 		 364 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>