27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_4613 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_4613  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 113 aa  229  9e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4592  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 113 aa  229  9e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4609  transcriptional regulator  68.18 
 
 		 115 aa  159  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.273253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4589  helix-turn-helix domain protein  68.18 
 
 		 115 aa  159  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0851  transcriptional regulator  46.36 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.36492e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0482  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0889934  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0847  hypothetical protein  45.45 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2601  putative transcriptional regulator  44.07 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0680466  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 125 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0148  transcriptional regulator, XRE family  47.27 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1891  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1998  hypothetical protein  39.29 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.846621  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0826  XRE family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000131659  unclonable  0.000000470251 
 
 
-
 
NC_004310  BR2077  hypothetical protein  39.29 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0843  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1318  transcriptional regulator, XRE family  56.76 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  31.4 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  31.4 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  31.4 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 184 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1223  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  34.78 
 
 		 316 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117145  normal  0.0124179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1326  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  30.68 
 
 		 309 aa  40.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783299  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2752  XRE family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272342  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3867  Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>