107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0798 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0798  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 73 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0286273  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0815  Cro/CI family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 71 aa  50.1  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 206 aa  50.4  0.000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 114 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0037  hypothetical protein  35.59 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1603  DNA-binding protein  38.98 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00182563  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  36.84 
 
 		 206 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1714  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000253714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  34.48 
 
 		 200 aa  47.4  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 137 aa  47.4  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 205 aa  47  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0189  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0397  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000557711  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  39.66 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0407  helix-turn-helix domain-containing protein  41.38 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000097753  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0954  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1626  helix-turn-helix domain protein  37.1 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.365666 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 231 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  42.55 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2034  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  38.18 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 321 aa  44.3  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2248  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529166 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0313  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.834607 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1983  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.418857  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  34.48 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  45 
 
 		 205 aa  44.3  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4511  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11449  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1115  transcriptional regulator, Cro/CI family  33.9 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.253142  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 244 aa  43.5  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2664  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 83 aa  43.5  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.406995 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  30 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0576  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016932  normal  0.922143 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0638  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000543981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2734  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00297691  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 346 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0703  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000971993  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  36.21 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  36.21 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  37.29 
 
 		 377 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3410  transcriptional regulator, XRE family protein  37.93 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  36.21 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0917  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 273 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0686  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  37.29 
 
 		 436 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0591  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0279  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 82 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00143869  normal  0.616249 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 69 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4290  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 70 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34926  normal  0.146409 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 142 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  29.23 
 
 		 377 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 133 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 117 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 77 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6868  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 250 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815043  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  47.06 
 
 		 302 aa  41.2  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0656  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05270  predicted transcriptional regulator  35.59 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4734  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.138063  normal  0.154831 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  37.7 
 
 		 347 aa  41.2  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  33.9 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0534  transcriptional regulator, XRE family  28.77 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000443779  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2077  hypothetical protein  35.59 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0068  XRE family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1998  hypothetical protein  35.59 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.846621  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2790  helix-turn-helix domain protein  37.25 
 
 		 393 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 224 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  30.51 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  32.2 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2570  hypothetical protein  36.96 
 
 		 430 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258744  normal  0.5369 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>