66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0917 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0917  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 78 aa  156  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1603  DNA-binding protein  50.85 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00182563  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0118  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0240  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 81 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000370797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0954  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0703  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000971993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0189  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0772  putative transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 199 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0981  DNA-binding protein  40 
 
 		 183 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2664  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.406995 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0591  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05270  predicted transcriptional regulator  37.7 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1088  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1714  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000253714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0995  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.651052 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5865  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2470  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.452519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  39.34 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 199 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  30.99 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  30.99 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2210  putative DNA-binding protein  41.82 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0957  hypothetical protein  38.6 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4719  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.155246 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  30.99 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  30.99 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0798  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0286273  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1983  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 64 aa  42  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.418857  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  42.11 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.99 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  30.99 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  30.99 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 71 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 371 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  32.08 
 
 		 131 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0777  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000109093  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3445  helix-turn-helix domain-containing protein  41.51 
 
 		 335 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2780  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 152 aa  41.2  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  31.34 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4268  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2294  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.57 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00599682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  37.04 
 
 		 508 aa  40.8  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1520  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0757766  normal  0.0239869 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 209 aa  40.8  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_002950  PG1535  transcriptional regulator, putative  34.92 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00452655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3903  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.009018  normal  0.0135287 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 224 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 68 aa  40  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1555  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 181 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  40 
 
 		 67 aa  40  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0037  hypothetical protein  27.87 
 
 		 68 aa  40  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 77 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>