35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1603 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1603  DNA-binding protein  100 
 
 		 62 aa  124  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00182563  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0917  XRE family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0703  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 84 aa  52  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000971993  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0798  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0286273  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2210  putative DNA-binding protein  36.21 
 
 		 61 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0240  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000370797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1714  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000253714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0118  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0772  putative transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 199 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  33.33 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0995  transcriptional regulator, XRE family  30.36 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.651052 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0893  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 110 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00171565  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 91 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  32.2 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  32.14 
 
 		 194 aa  41.2  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 320 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  33.33 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  32.76 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 312 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  32.76 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  32.76 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  33.33 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  33.33 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  35.56 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  34.48 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0189  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 231 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 78 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>