32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2470 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2470  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 113 aa  226  7e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.452519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  35 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0118  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  43.48 
 
 		 383 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0240  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000370797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  32.31 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0917  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1818  helix-turn-helix domain protein  36.07 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0350108  decreased coverage  0.0000000000623016 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0389  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762812  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0777  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000109093  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4575  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 124 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.810922 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4442  DNA-binding protein  35.59 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0755  DNA-binding protein  35.59 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4481  DNA-binding protein  35.59 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4443  DNA-binding protein  35.59 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2054  transcriptional regulator, XRE family  34.88 
 
 		 186 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.388224 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4493  DNA-binding protein  35.59 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4590  DNA-binding protein  35.59 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4105  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4094  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4258  DNA-binding protein  35.59 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3080  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.995144  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 211 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 209 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 194 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1142  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 141 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.343255  normal  0.597064 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>