49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4734 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4734  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 82 aa  169  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.138063  normal  0.154831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3627  transcriptional regulator, XRE family  48.61 
 
 		 87 aa  80.5  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4414  transcriptional regulator, XRE family  52.24 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.514306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3774  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0502189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1799  transcriptional regulator, XRE family  39.76 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2500  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_264  hypothetical protein  45 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3770  transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4293  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 239 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3108  N-6 DNA methylase  46.43 
 
 		 610 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0746  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.376996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3947  transcriptional regulator, XRE family  51.79 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0387  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 73 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000537599 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5367  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.216549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0107  helix-turn-helix domain protein  40.82 
 
 		 297 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1458  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1065  XRE family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal  0.845779 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  41.51 
 
 		 348 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2833  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  39.22 
 
 		 436 aa  43.9  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4076  helix-turn-helix domain-containing protein  34.62 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541899 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4415  helix-turn-helix DNA-binding domain-containing protein  34.67 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04240  Transcriptional regulator with Fis-type helix-turn-helix motif  37.5 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0576  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016932  normal  0.922143 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0638  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000543981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4424  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 96 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.107938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4313  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 96 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4359  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 96 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.272342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4246  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 96 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4268  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  36.54 
 
 		 244 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1889  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 203 aa  41.6  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3572  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3177  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0647326  normal  0.0138701 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0798  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0286273  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  45.24 
 
 		 272 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1020  transcriptional regulator, XRE family  47.5 
 
 		 103 aa  41.2  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0786  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5296  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  39.62 
 
 		 369 aa  40.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0850  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.07607  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5658  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  38.89 
 
 		 508 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2054  hypothetical protein  38.78 
 
 		 255 aa  40  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 		 147 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>