37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0450 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0450  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
268 aa  545  1e-154  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  36.56 
 
 
104 aa  55.5  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 
139 aa  55.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  37.35 
 
 
125 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 
115 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 
115 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  41.03 
 
 
128 aa  49.3  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2792  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 
124 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 
139 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  38.75 
 
 
137 aa  47.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 
117 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0513  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 
70 aa  47  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.041665  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 
114 aa  46.6  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 
115 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 
152 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  34.44 
 
 
125 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0656  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 
71 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  34.67 
 
 
125 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  34.44 
 
 
125 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  34.44 
 
 
125 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  34.44 
 
 
125 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  34.44 
 
 
125 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  39.44 
 
 
114 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  34.44 
 
 
125 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  34.44 
 
 
125 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 
111 aa  43.5  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
101 aa  43.5  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  39.44 
 
 
114 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  36.23 
 
 
142 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 
123 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 
133 aa  43.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 
142 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 
133 aa  42.7  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  33.71 
 
 
301 aa  42.7  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  35.62 
 
 
145 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>