56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1991 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1991  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  414  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1926  XRE family transcriptional regulator  74.23 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 115 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 115 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 370 aa  49.3  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 152 aa  48.9  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0433  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 273 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  38.71 
 
 		 369 aa  46.6  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  39.66 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 380 aa  45.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  37.74 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  31.4 
 
 		 135 aa  45.1  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  31.94 
 
 		 114 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  31.94 
 
 		 114 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  32.79 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  34.43 
 
 		 301 aa  44.3  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 321 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  33.93 
 
 		 163 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  34.33 
 
 		 67 aa  44.3  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 231 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3849  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 87 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0299228  normal  0.323457 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 		 117 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 91 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1604  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 374 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 152 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 262 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 261 aa  42.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2190  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  32.53 
 
 		 262 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  35.09 
 
 		 262 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 91 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  35.09 
 
 		 262 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 182 aa  42.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 115 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  29.11 
 
 		 143 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 73 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  28.81 
 
 		 200 aa  42  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  33.93 
 
 		 67 aa  42  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  31.17 
 
 		 194 aa  42  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  31.15 
 
 		 338 aa  42  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 281 aa  42  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  28.79 
 
 		 115 aa  41.6  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 327 aa  42  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 114 aa  41.6  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 244 aa  41.6  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  32.14 
 
 		 459 aa  41.6  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  30.38 
 
 		 114 aa  41.6  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 104 aa  41.6  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 108 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 108 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0803  hypothetical protein  35.48 
 
 		 255 aa  41.2  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0115457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>