298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0673 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0673  cobalamin B12-binding domain protein  100 
 
 		 349 aa  717    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.846284 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2473  cobalamin B12-binding domain-containing protein  42.67 
 
 		 398 aa  240  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169304 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3086  hypothetical protein  46.77 
 
 		 201 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1691  cobalamin B12-binding domain protein  36.69 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0108  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.14 
 
 		 356 aa  160  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0291  cobalamin B12-binding domain protein  42.08 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  28.8 
 
 		 372 aa  142  6e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3258  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.1 
 
 		 370 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1467  cobalamin B12-binding  31.62 
 
 		 364 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2639  cobalamin B12-binding  31.43 
 
 		 222 aa  123  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  31.71 
 
 		 301 aa  122  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1030  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.99 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0967  cobalamin B12-binding domain protein  33.73 
 
 		 325 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502888  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0655  cobalamin B12-binding domain protein  23.35 
 
 		 384 aa  88.6  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4920  cobalamin B12-binding domain protein  29.29 
 
 		 366 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230842  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2584  cobalamin B12-binding domain protein  30.57 
 
 		 354 aa  87.4  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0156694 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0675  cobalamin B12-binding domain protein  34.64 
 
 		 224 aa  85.9  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000394435  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5806  cobalamin B12-binding domain-containing protein  35.56 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3335  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.07 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3324  cobalamin B12-binding protein  31.07 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3386  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.07 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0329482 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2784  cobalamin B12-binding protein  29.7 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0108719  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  27.8 
 
 		 212 aa  82  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  26.55 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  26.38 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  26.48 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.55 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  28.12 
 
 		 607 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4482  cobalamin binding protein-like protein  28.27 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000437324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  29.65 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  30.77 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  24.64 
 
 		 768 aa  77.4  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  27.14 
 
 		 818 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  29.81 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  25.6 
 
 		 214 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.48 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  29.33 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35010  predicted cobalamin binding protein  26.26 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.77206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.88 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  31.1 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  22.83 
 
 		 802 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  25.98 
 
 		 841 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0720  cobalamin B12-binding domain protein  23.28 
 
 		 211 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  27.81 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  26.99 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  23.22 
 
 		 768 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  26.23 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2044  cobalamin B12-binding domain protein  28.8 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.10014 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  28.78 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  28.57 
 
 		 168 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  29.17 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  26.6 
 
 		 780 aa  70.9  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3658  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.59 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  24.88 
 
 		 800 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  31.11 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5363  cobalamin B12-binding domain protein  26.79 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.222451 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0978  response regulator receiver protein  26.39 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144383 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  25.21 
 
 		 804 aa  69.3  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2387  B12-binding domain-containing protein  27.68 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  28.44 
 
 		 816 aa  67.4  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  27.98 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5159  twin-arginine translocation pathway signal  31.31 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5248  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.31 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5540  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.31 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1603  cobalamin B12-binding domain protein  26.67 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000910131  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.43 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0061  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.62 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  24.66 
 
 		 804 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  23.25 
 
 		 841 aa  67  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  30.13 
 
 		 804 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2368  cobalamin B12-binding domain protein  25.3 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  26.15 
 
 		 804 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  24.19 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3983  cobalamin B12-binding  26.67 
 
 		 297 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.110014 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  31.71 
 
 		 820 aa  65.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  29.05 
 
 		 210 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  27.73 
 
 		 804 aa  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1728  cobalamin B12-binding domain protein  27.4 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4337  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.11 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.125438  normal  0.389787 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0597  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.71 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  28.08 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2104  cobalamin B12-binding domain protein  29.47 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  25.81 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  30.25 
 
 		 791 aa  64.3  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  24.66 
 
 		 803 aa  63.9  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  25.81 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5285  cobalamin B12-binding  24.45 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.109441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4818  cobalamin B12-binding  24.56 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282742 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0539  cobalamin B12-binding domain protein  24.84 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  28.74 
 
 		 801 aa  63.2  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2751  cobalamin B12-binding protein  28.96 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  31.09 
 
 		 819 aa  63.2  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0840  monomethylamine corrinoid protein  32.2 
 
 		 217 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.960899  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0847  monomethylamine corrinoid protein  32.2 
 
 		 217 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  27.55 
 
 		 804 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  29.79 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1827  cobalamin B12-binding domain protein  31.75 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>