58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5248 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5540  cobalamin B12-binding domain-containing protein  100 
 
 		 336 aa  655    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5248  cobalamin B12-binding domain-containing protein  100 
 
 		 336 aa  655    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5159  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 336 aa  655    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35010  predicted cobalamin binding protein  43.5 
 
 		 363 aa  259  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.77206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1030  cobalamin B12-binding domain-containing protein  35.63 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4920  cobalamin B12-binding domain protein  35.89 
 
 		 366 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230842  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2584  cobalamin B12-binding domain protein  35.76 
 
 		 354 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0156694 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3335  cobalamin B12-binding domain-containing protein  35.02 
 
 		 360 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3324  cobalamin B12-binding protein  35.02 
 
 		 360 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3386  cobalamin B12-binding domain-containing protein  35.02 
 
 		 360 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0329482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4482  cobalamin binding protein-like protein  36.31 
 
 		 351 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000437324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0967  cobalamin B12-binding domain protein  36.55 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502888  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5806  cobalamin B12-binding domain-containing protein  36.54 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0291  cobalamin B12-binding domain protein  30.08 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2639  cobalamin B12-binding  27.33 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  30.41 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2473  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.42 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169304 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0673  cobalamin B12-binding domain protein  31.31 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.846284 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  28.8 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  36.43 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0108  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.65 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  34.29 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  20.41 
 
 		 807 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  25.24 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3258  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.37 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1467  cobalamin B12-binding  28.57 
 
 		 364 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.37 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1691  cobalamin B12-binding domain protein  28.42 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0675  cobalamin B12-binding domain protein  25.97 
 
 		 224 aa  57  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000394435  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1041  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.87 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.388992 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3086  hypothetical protein  26.34 
 
 		 201 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  19.5 
 
 		 212 aa  52.8  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0956  cobalamin B12-binding protein  22.28 
 
 		 214 aa  52.8  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  26.63 
 
 		 816 aa  52.4  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  27.36 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  25.12 
 
 		 804 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  26.96 
 
 		 801 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  21.98 
 
 		 216 aa  50.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  24.73 
 
 		 207 aa  49.7  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  23.15 
 
 		 806 aa  49.3  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2387  B12-binding domain-containing protein  29.07 
 
 		 226 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0978  response regulator receiver protein  23.02 
 
 		 280 aa  48.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144383 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  24.18 
 
 		 207 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  20.6 
 
 		 209 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  25.74 
 
 		 607 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  20.5 
 
 		 210 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  21.05 
 
 		 1136 aa  46.2  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  20 
 
 		 210 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  24.4 
 
 		 811 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  23.08 
 
 		 217 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0655  cobalamin B12-binding domain protein  20.73 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  24.4 
 
 		 813 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  23.41 
 
 		 804 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  22.88 
 
 		 1132 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  21.35 
 
 		 1136 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  23.36 
 
 		 801 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  23.65 
 
 		 818 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5363  cobalamin B12-binding domain protein  26.94 
 
 		 295 aa  42.7  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.222451 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>