52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0655 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0655  cobalamin B12-binding domain protein  100 
 
 		 384 aa  794    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3258  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.61 
 
 		 370 aa  172  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  25.54 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0673  cobalamin B12-binding domain protein  23.35 
 
 		 349 aa  88.6  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.846284 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1467  cobalamin B12-binding  28.43 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0291  cobalamin B12-binding domain protein  27.23 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3086  hypothetical protein  27.18 
 
 		 201 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  26.07 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2473  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.78 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169304 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2639  cobalamin B12-binding  25.45 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  26.04 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0978  response regulator receiver protein  23.35 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144383 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1691  cobalamin B12-binding domain protein  21.67 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2584  cobalamin B12-binding domain protein  23.04 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0156694 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  30.65 
 
 		 804 aa  57  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0108  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.49 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  25.97 
 
 		 319 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  21.5 
 
 		 807 aa  54.3  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.5 
 
 		 305 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  26.49 
 
 		 319 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  28 
 
 		 780 aa  54.3  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1030  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.44 
 
 		 358 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3738  cobalamin B12-binding  23.89 
 
 		 295 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0514741  hitchhiker  0.000397426 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  20.39 
 
 		 841 aa  50.8  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3324  cobalamin B12-binding protein  22.76 
 
 		 360 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3386  cobalamin B12-binding domain-containing protein  22.76 
 
 		 360 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0329482 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  21.84 
 
 		 774 aa  50.4  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3335  cobalamin B12-binding domain-containing protein  22.76 
 
 		 360 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0675  cobalamin B12-binding domain protein  22.16 
 
 		 224 aa  50.1  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000394435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0720  cobalamin B12-binding domain protein  22.22 
 
 		 211 aa  49.7  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  24.18 
 
 		 791 aa  49.3  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  22.07 
 
 		 793 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0967  cobalamin B12-binding domain protein  24.64 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502888  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  24.15 
 
 		 214 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3716  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.49 
 
 		 288 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.103124  hitchhiker  0.00389814 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5806  cobalamin B12-binding domain-containing protein  21.17 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0061  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.35 
 
 		 217 aa  47.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  22.8 
 
 		 1157 aa  47  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  25.29 
 
 		 214 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0678  hypothetical protein  20.38 
 
 		 281 aa  46.6  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1605  cobalamin B12-binding domain protein  24.84 
 
 		 212 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000212682  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  24.88 
 
 		 1158 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5159  twin-arginine translocation pathway signal  20.73 
 
 		 336 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5540  cobalamin B12-binding domain-containing protein  20.73 
 
 		 336 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5248  cobalamin B12-binding domain-containing protein  20.73 
 
 		 336 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  23.13 
 
 		 806 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3881  cobalamin B12-binding domain protein  26.24 
 
 		 216 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000148578  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  23.48 
 
 		 251 aa  43.9  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1728  cobalamin B12-binding domain protein  21.83 
 
 		 293 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1311  cobalamin B12-binding  21.52 
 
 		 289 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.650213 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  30.36 
 
 		 781 aa  43.9  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3983  cobalamin B12-binding  22.67 
 
 		 297 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.110014 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>