96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4482 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4482  cobalamin binding protein-like protein  100 
 
 		 351 aa  684    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000437324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1030  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.49 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3324  cobalamin B12-binding protein  52.99 
 
 		 360 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3335  cobalamin B12-binding domain-containing protein  52.99 
 
 		 360 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3386  cobalamin B12-binding domain-containing protein  52.99 
 
 		 360 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0329482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4920  cobalamin B12-binding domain protein  56.33 
 
 		 366 aa  323  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230842  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5806  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.2 
 
 		 354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2584  cobalamin B12-binding domain protein  46.95 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0156694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0967  cobalamin B12-binding domain protein  47.27 
 
 		 325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502888  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35010  predicted cobalamin binding protein  35.69 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.77206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5248  cobalamin B12-binding domain-containing protein  35.8 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5159  twin-arginine translocation pathway signal  35.8 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5540  cobalamin B12-binding domain-containing protein  35.8 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2639  cobalamin B12-binding  30.46 
 
 		 222 aa  102  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  31.33 
 
 		 372 aa  94  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1467  cobalamin B12-binding  35.2 
 
 		 364 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0673  cobalamin B12-binding domain protein  29.25 
 
 		 349 aa  90.9  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.846284 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0291  cobalamin B12-binding domain protein  31.21 
 
 		 356 aa  86.7  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1691  cobalamin B12-binding domain protein  31.75 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3258  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.95 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.05 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2473  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.18 
 
 		 398 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169304 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0108  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.14 
 
 		 356 aa  72  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  19.51 
 
 		 301 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  33.83 
 
 		 319 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  33.91 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  33.08 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  28.16 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3086  hypothetical protein  25.97 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0978  response regulator receiver protein  23.02 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144383 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  26.92 
 
 		 213 aa  62.4  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  24.74 
 
 		 780 aa  60.1  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  24.1 
 
 		 806 aa  59.7  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  23.91 
 
 		 768 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  28.21 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  22.68 
 
 		 807 aa  56.6  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  24.46 
 
 		 801 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  26.15 
 
 		 804 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  22.83 
 
 		 768 aa  56.2  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  27.59 
 
 		 607 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  23.27 
 
 		 781 aa  55.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2567  cobalamin B12-binding domain protein  22.45 
 
 		 206 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474708  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1060  MerR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  32.54 
 
 		 318 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  29.17 
 
 		 224 aa  53.9  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 293 aa  53.9  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  22.82 
 
 		 218 aa  53.5  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  23.39 
 
 		 839 aa  52.8  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0797  methionine synthase  26.67 
 
 		 232 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.310628  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0675  cobalamin B12-binding domain protein  25 
 
 		 224 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000394435  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  18.63 
 
 		 793 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2122  putative dimethylamine corrinoid protein  26.67 
 
 		 232 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.154357  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  30.25 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3738  cobalamin B12-binding  29.91 
 
 		 295 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0514741  hitchhiker  0.000397426 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0061  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.3 
 
 		 217 aa  50.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1728  cobalamin B12-binding domain protein  29.25 
 
 		 293 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2387  B12-binding domain-containing protein  30.08 
 
 		 226 aa  49.7  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  25 
 
 		 232 aa  49.7  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1311  cobalamin B12-binding  24.62 
 
 		 221 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.460326 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  24.34 
 
 		 811 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  25.11 
 
 		 816 aa  47.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5363  cobalamin B12-binding domain protein  29.81 
 
 		 295 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.222451 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3658  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.41 
 
 		 210 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  25.64 
 
 		 210 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2104  cobalamin B12-binding domain protein  26.09 
 
 		 228 aa  47  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  26.63 
 
 		 1168 aa  46.6  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 335 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0707  methionine synthase  25 
 
 		 232 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.784551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  25.49 
 
 		 322 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5173  transcriptional regulator, MerR family  23.39 
 
 		 291 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  23.59 
 
 		 813 aa  46.6  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  23.64 
 
 		 804 aa  46.2  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1602  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 295 aa  46.2  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.200885  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.22 
 
 		 219 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.35 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  24.37 
 
 		 212 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  25.93 
 
 		 804 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  26.32 
 
 		 220 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1267  methionine synthase  20.97 
 
 		 832 aa  45.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1470  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  23.33 
 
 		 232 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  22.9 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  23.48 
 
 		 209 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.35 
 
 		 219 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  22 
 
 		 819 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  27.45 
 
 		 1180 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2550  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  23.33 
 
 		 235 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0597  cobalamin B12-binding domain-containing protein  20.63 
 
 		 218 aa  44.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  26.55 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  21.98 
 
 		 210 aa  43.9  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3983  cobalamin B12-binding  29.25 
 
 		 297 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.110014 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  25.13 
 
 		 1196 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4818  cobalamin B12-binding  26.59 
 
 		 295 aa  43.5  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282742 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  25.31 
 
 		 1208 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5285  cobalamin B12-binding  27.17 
 
 		 295 aa  43.1  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.109441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1431  cobalamin B12-binding domain-containing protein  22.13 
 
 		 222 aa  42.7  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000156586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>