130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0956 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0956  cobalamin B12-binding protein  100 
 
 		 214 aa  426  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1431  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.68 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  25.36 
 
 		 804 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0847  monomethylamine corrinoid protein  27.19 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  30 
 
 		 807 aa  72  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  26.2 
 
 		 801 aa  71.6  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  24.04 
 
 		 818 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  28.57 
 
 		 768 aa  70.5  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0840  monomethylamine corrinoid protein  26.27 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.960899  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  28.57 
 
 		 768 aa  68.9  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  25 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  24.3 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  27.62 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  26.97 
 
 		 804 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0720  cobalamin B12-binding domain protein  23.04 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2387  B12-binding domain-containing protein  26.37 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  29.05 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2751  cobalamin B12-binding protein  25.88 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  26.42 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  27.68 
 
 		 841 aa  62.8  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  25.25 
 
 		 800 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2104  cobalamin B12-binding domain protein  26.47 
 
 		 228 aa  62  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  25.59 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  27.27 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1304  cobalamin B12-binding domain protein  27.66 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2473  cobalamin B12-binding domain-containing protein  22.54 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169304 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  29.41 
 
 		 793 aa  60.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  25.7 
 
 		 804 aa  60.1  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2567  cobalamin B12-binding domain protein  26.51 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474708  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  26.74 
 
 		 820 aa  60.1  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  27.81 
 
 		 774 aa  58.9  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2929  cobalamin B12-binding domain protein  30.51 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000012726  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  29.52 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  24.02 
 
 		 802 aa  58.5  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  25.24 
 
 		 780 aa  58.5  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1691  cobalamin B12-binding domain protein  22.05 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  27.27 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  25.98 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  21.95 
 
 		 841 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  27.27 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  25.67 
 
 		 816 aa  57  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  27.22 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.41 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  27.16 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  24.76 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  26.7 
 
 		 791 aa  55.8  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4611  cobalamin B12-binding domain protein  27.27 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.855843  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  20.21 
 
 		 372 aa  55.1  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  26.58 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3086  hypothetical protein  22.5 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  24.35 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1107  cobalamin B12-binding domain protein  30.12 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5159  twin-arginine translocation pathway signal  22.28 
 
 		 336 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5248  cobalamin B12-binding domain-containing protein  22.28 
 
 		 336 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  23.28 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5540  cobalamin B12-binding domain-containing protein  22.28 
 
 		 336 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0978  response regulator receiver protein  24.18 
 
 		 280 aa  52.8  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144383 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  28.68 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  23.5 
 
 		 1158 aa  51.6  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  20.88 
 
 		 1149 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0061  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.83 
 
 		 217 aa  51.6  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0842  monomethylamine corrinoid protein  28.25 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0024  methyltransferase cognate corrinoid protein  23.86 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  24.14 
 
 		 839 aa  51.2  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3881  cobalamin B12-binding domain protein  24.47 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000148578  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0291  cobalamin B12-binding domain protein  23 
 
 		 356 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1895  cobalamin B12-binding domain protein  27.44 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3634  monomethylamine corrinoid protein  27.78 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  27.19 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1467  cobalamin B12-binding  21.14 
 
 		 364 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0845  monomethylamine corrinoid protein  25.99 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35010  predicted cobalamin binding protein  21.95 
 
 		 363 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.77206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  22.22 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  24.43 
 
 		 293 aa  49.7  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  25.14 
 
 		 781 aa  49.3  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1368  trimethylamine corrinoid protein  25.84 
 
 		 216 aa  48.9  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000818926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  22.96 
 
 		 813 aa  48.9  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1603  cobalamin B12-binding domain protein  30.18 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000910131  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  23.67 
 
 		 804 aa  48.5  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2784  cobalamin B12-binding protein  23.2 
 
 		 221 aa  48.1  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0108719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1311  cobalamin B12-binding  26.19 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.460326 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  23.21 
 
 		 811 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.19 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0108  cobalamin B12-binding domain-containing protein  21.43 
 
 		 356 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1041  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.15 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.388992 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2776  transcriptional regulator  24.31 
 
 		 290 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0673  cobalamin B12-binding domain protein  18.69 
 
 		 349 aa  47  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.846284 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.19 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  19.67 
 
 		 1150 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1835  cobalamin B12-binding domain protein  27.16 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  21.99 
 
 		 803 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  18.04 
 
 		 1136 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.72 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.81 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0195  cobalamin B12-binding domain protein  25 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543164  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1030  cobalamin B12-binding domain-containing protein  20.83 
 
 		 358 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  23.32 
 
 		 804 aa  45.4  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  24.38 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  19.52 
 
 		 319 aa  45.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  19.02 
 
 		 1150 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>