More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1304 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1304  cobalamin B12-binding domain protein  100 
 
 		 216 aa  442  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0195  cobalamin B12-binding domain protein  39.71 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543164  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  36.51 
 
 		 816 aa  98.6  7e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  35.05 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  31.79 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  31.37 
 
 		 768 aa  90.5  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  34.02 
 
 		 210 aa  88.6  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  30.88 
 
 		 768 aa  88.6  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.32 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1107  cobalamin B12-binding domain protein  31.25 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  30 
 
 		 218 aa  85.5  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  29.79 
 
 		 212 aa  84.7  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  31.77 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4611  cobalamin B12-binding domain protein  33.53 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.855843  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  29 
 
 		 607 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  31.03 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  28.85 
 
 		 839 aa  82.8  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  27.69 
 
 		 774 aa  81.3  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  31.58 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4321  cobalamin B12-binding domain protein  26.34 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0811  methanol corrinoid protein  26.46 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3637  methanol corrinoid protein  34.27 
 
 		 255 aa  78.2  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  28.49 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1895  cobalamin B12-binding domain protein  29.06 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0740  methanol corrinoid protein  33.57 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  34.01 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  34.01 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  33.33 
 
 		 1156 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0112  B12-dependent methionine synthase  32.8 
 
 		 1259 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.937971  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  36.28 
 
 		 807 aa  76.3  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  26.24 
 
 		 804 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  29.03 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  32.2 
 
 		 1168 aa  75.5  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1368  trimethylamine corrinoid protein  30.11 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000818926  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  32.57 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2929  cobalamin B12-binding domain protein  28.99 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000012726  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  38.4 
 
 		 1151 aa  75.1  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  29.27 
 
 		 818 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0813  methanol corrinoid protein  32.21 
 
 		 256 aa  74.7  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  35.71 
 
 		 791 aa  74.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1041  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.68 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.388992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  35.25 
 
 		 801 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  36.97 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2310  trimethylamine corrinoid protein  30.23 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00299987  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  26.26 
 
 		 617 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0595  B12-dependent methionine synthase  38.6 
 
 		 1272 aa  73.2  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2964  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.61 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0486605  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  31.25 
 
 		 802 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  38 
 
 		 1232 aa  73.2  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0024  methyltransferase cognate corrinoid protein  30.83 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2137  methionine synthase  40.82 
 
 		 1245 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.39755 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2671  methionine synthase  36.36 
 
 		 1269 aa  72.4  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2631  B12-dependent methionine synthase  34.33 
 
 		 1244 aa  72.4  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0960245  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  34.23 
 
 		 259 aa  72  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3735  B12-dependent methionine synthase  31.03 
 
 		 1286 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.391435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  36.75 
 
 		 1228 aa  72  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  26.86 
 
 		 217 aa  72  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  28.49 
 
 		 1178 aa  72  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  28.35 
 
 		 220 aa  72  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45056  B12 dependent methionine synthase  33.59 
 
 		 1252 aa  71.6  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00353368  normal  0.902557 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1063  methanol corrinoid protein  30.77 
 
 		 258 aa  71.6  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  31.28 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1643  B12-dependent methionine synthase  39.42 
 
 		 1262 aa  71.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0494405 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  36.61 
 
 		 1158 aa  71.6  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  28.65 
 
 		 804 aa  71.6  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  29.03 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1827  cobalamin B12-binding domain protein  28.49 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  27.75 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  40 
 
 		 1193 aa  71.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  36.97 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  26.9 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3690  B12-dependent methionine synthase  30.83 
 
 		 1220 aa  71.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  31.01 
 
 		 1173 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  33.07 
 
 		 1239 aa  70.1  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  26.67 
 
 		 800 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3206  methionine synthase (B12-dependent)  30.88 
 
 		 878 aa  70.1  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.336651  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  28.49 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  37.25 
 
 		 1226 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  29.5 
 
 		 781 aa  70.1  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  33.08 
 
 		 1251 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1526  B12-dependent methionine synthase  31.65 
 
 		 1232 aa  69.7  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0363  B12-dependent methionine synthase  30.69 
 
 		 1261 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  28.49 
 
 		 1183 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  31.54 
 
 		 1171 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  30.22 
 
 		 556 aa  69.3  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  31.02 
 
 		 1237 aa  68.9  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1961  methionine synthase  33.61 
 
 		 1253 aa  68.9  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.23883  hitchhiker  0.00552664 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  31.54 
 
 		 1167 aa  68.9  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2467  methionine synthase  32.56 
 
 		 1261 aa  68.9  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1692  B12-dependent methionine synthase  37 
 
 		 1224 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4435  B12-dependent methionine synthase  31.29 
 
 		 1227 aa  68.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0720  cobalamin B12-binding domain protein  26.59 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3053  B12-dependent methionine synthase  31.58 
 
 		 1251 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.453999 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  33.65 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  30.61 
 
 		 1227 aa  68.6  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2169  methionine synthase  33.82 
 
 		 1245 aa  68.2  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.205577  normal  0.226732 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2567  cobalamin B12-binding domain protein  25.47 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474708  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  40.59 
 
 		 1266 aa  68.2  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0758  B12-dependent methionine synthase  31.98 
 
 		 1246 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.659122  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>