More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0195 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0195  cobalamin B12-binding domain protein  100 
 
 		 218 aa  437  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543164  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1304  cobalamin B12-binding domain protein  39.71 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  33.67 
 
 		 801 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  31.22 
 
 		 768 aa  106  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  33.33 
 
 		 811 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  32.84 
 
 		 813 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  33.84 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  29.27 
 
 		 768 aa  101  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  32.35 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3658  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.56 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.3 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  33.33 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  31.88 
 
 		 804 aa  95.9  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  32.86 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  30.85 
 
 		 800 aa  95.1  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2929  cobalamin B12-binding domain protein  29.95 
 
 		 216 aa  95.1  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000012726  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  35.76 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  33.67 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1368  trimethylamine corrinoid protein  32.35 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000818926  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2310  trimethylamine corrinoid protein  32.94 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00299987  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  34.71 
 
 		 214 aa  93.2  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  31.25 
 
 		 804 aa  93.2  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  33.33 
 
 		 820 aa  92.8  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  30.43 
 
 		 816 aa  92.8  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  32.35 
 
 		 818 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4641  cobalamin B12-binding domain protein  31.58 
 
 		 213 aa  92.4  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  29.86 
 
 		 607 aa  92  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  33.66 
 
 		 841 aa  92  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  31.77 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  30.62 
 
 		 774 aa  91.3  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  28.64 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  31.18 
 
 		 224 aa  90.9  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4321  cobalamin B12-binding domain protein  26.83 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  30.1 
 
 		 804 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4611  cobalamin B12-binding domain protein  30.05 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.855843  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  29.9 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  32.77 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  30.88 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3584  methylthiol:coenzyme M methyltransferase  33.18 
 
 		 275 aa  89  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812541  normal  0.0358178 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4337  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.56 
 
 		 326 aa  88.2  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.125438  normal  0.389787 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  32.95 
 
 		 804 aa  87.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  31.76 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  32.61 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  32.61 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  30.85 
 
 		 806 aa  87.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  31.22 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  30.2 
 
 		 804 aa  85.5  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  32.57 
 
 		 839 aa  85.1  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  32.02 
 
 		 802 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  31.84 
 
 		 801 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  34.33 
 
 		 803 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  35.09 
 
 		 1136 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  28.71 
 
 		 841 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  32.35 
 
 		 1136 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  31.61 
 
 		 791 aa  82.8  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.21 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  30.66 
 
 		 1193 aa  82.8  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1895  cobalamin B12-binding domain protein  26.32 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  32.67 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2784  cobalamin B12-binding protein  26.24 
 
 		 221 aa  81.3  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0108719  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.24 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.87 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  32.39 
 
 		 804 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  37.93 
 
 		 781 aa  80.1  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  30.18 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.76 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  35.76 
 
 		 1176 aa  80.1  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  28.96 
 
 		 617 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1827  cobalamin B12-binding domain protein  26.96 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2751  cobalamin B12-binding protein  32.47 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  41.49 
 
 		 556 aa  79.3  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2104  cobalamin B12-binding domain protein  37.86 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2964  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.1 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0486605  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  29.51 
 
 		 1267 aa  78.6  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  40.91 
 
 		 1266 aa  78.6  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0811  methanol corrinoid protein  29.03 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1107  cobalamin B12-binding domain protein  27.09 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  29.03 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  27.91 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  33.33 
 
 		 1154 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  33.93 
 
 		 1158 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2567  cobalamin B12-binding domain protein  33.33 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  31.87 
 
 		 1132 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  34.11 
 
 		 224 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0024  methyltransferase cognate corrinoid protein  39.23 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.87 
 
 		 1133 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  33.96 
 
 		 1181 aa  77.4  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1979  methionine synthase  29.8 
 
 		 916 aa  77  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  30.41 
 
 		 780 aa  77.4  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  34.97 
 
 		 1208 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  28.5 
 
 		 793 aa  77  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  36.07 
 
 		 1157 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  40.19 
 
 		 1169 aa  77  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  26.24 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  34.55 
 
 		 1154 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.87 
 
 		 1132 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.87 
 
 		 1133 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.87 
 
 		 1132 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.87 
 
 		 1132 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.87 
 
 		 1132 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>