More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5697 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  100 
 
 
617 aa  1276    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  23.33 
 
 
556 aa  137  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  36.27 
 
 
607 aa  135  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  27.04 
 
 
372 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  36.36 
 
 
224 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  37.75 
 
 
209 aa  129  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  34.31 
 
 
212 aa  126  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  34.11 
 
 
213 aa  126  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  28.53 
 
 
319 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  37.37 
 
 
212 aa  124  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  35.1 
 
 
208 aa  124  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  39.23 
 
 
1181 aa  123  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  33.97 
 
 
218 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  34.74 
 
 
210 aa  120  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  34.36 
 
 
259 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0845  monomethylamine corrinoid protein  37.63 
 
 
217 aa  117  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  36.76 
 
 
818 aa  117  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4337  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.99 
 
 
326 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.125438  normal  0.389787 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1470  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  35.58 
 
 
232 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  33.33 
 
 
210 aa  115  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0707  methionine synthase  34.11 
 
 
232 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.784551  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0597  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.86 
 
 
218 aa  115  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2122  putative dimethylamine corrinoid protein  35.58 
 
 
232 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.154357  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0797  methionine synthase  35.58 
 
 
232 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.310628  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  36.02 
 
 
841 aa  114  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  26.35 
 
 
363 aa  114  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  26.35 
 
 
363 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1368  trimethylamine corrinoid protein  29.84 
 
 
216 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000818926  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  33.18 
 
 
232 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2929  cobalamin B12-binding domain protein  32.46 
 
 
216 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000012726  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  27.37 
 
 
357 aa  113  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  31.88 
 
 
804 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  31.53 
 
 
220 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  26.35 
 
 
363 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  32.37 
 
 
217 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.92 
 
 
219 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.92 
 
 
219 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2310  trimethylamine corrinoid protein  30.05 
 
 
216 aa  111  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00299987  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  33.99 
 
 
804 aa  111  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  32.51 
 
 
1176 aa  110  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  34.35 
 
 
1158 aa  109  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  33.17 
 
 
804 aa  109  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  29.63 
 
 
210 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  33.77 
 
 
1216 aa  109  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.47 
 
 
219 aa  108  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0842  monomethylamine corrinoid protein  35.05 
 
 
217 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2550  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  33.19 
 
 
235 aa  108  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  35.47 
 
 
804 aa  108  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3658  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.53 
 
 
210 aa  107  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435157  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  34.19 
 
 
1226 aa  107  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  26.69 
 
 
335 aa  107  8e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  31.28 
 
 
804 aa  107  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0024  methyltransferase cognate corrinoid protein  33 
 
 
220 aa  107  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  31.22 
 
 
214 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  32.18 
 
 
800 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  33.33 
 
 
1157 aa  105  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  33.04 
 
 
1193 aa  104  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3634  monomethylamine corrinoid protein  34.02 
 
 
217 aa  104  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  34.25 
 
 
1195 aa  104  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  32.84 
 
 
210 aa  103  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  32.86 
 
 
1158 aa  103  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  31.54 
 
 
802 aa  103  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  32.84 
 
 
210 aa  103  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  34.05 
 
 
219 aa  103  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  32.23 
 
 
768 aa  103  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2784  cobalamin B12-binding protein  34.08 
 
 
221 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0108719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  29.19 
 
 
210 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  31.74 
 
 
1156 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  35.8 
 
 
214 aa  102  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  32.31 
 
 
1178 aa  102  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3349  methionine synthase  34.98 
 
 
1214 aa  101  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  32.07 
 
 
1173 aa  101  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  31.9 
 
 
813 aa  101  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4641  cobalamin B12-binding domain protein  33.91 
 
 
213 aa  101  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  31.43 
 
 
811 aa  101  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0840  monomethylamine corrinoid protein  35.87 
 
 
217 aa  100  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.960899  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0847  monomethylamine corrinoid protein  35.87 
 
 
217 aa  100  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  31.77 
 
 
1239 aa  100  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  32.89 
 
 
1154 aa  100  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  31.75 
 
 
839 aa  99.8  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  31.9 
 
 
804 aa  100  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  30.89 
 
 
1192 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  26.89 
 
 
375 aa  99  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  30.62 
 
 
1167 aa  99.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  30.33 
 
 
806 aa  99.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  35.43 
 
 
208 aa  98.6  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  29.52 
 
 
217 aa  99  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  30.58 
 
 
1184 aa  98.2  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  30.54 
 
 
801 aa  98.2  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  30.77 
 
 
251 aa  97.4  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  32.61 
 
 
1169 aa  97.4  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  30.33 
 
 
768 aa  97.1  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0113  B12-dependent methionine synthase  31.9 
 
 
1227 aa  97.1  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352445  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.56 
 
 
216 aa  95.9  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  30.62 
 
 
1171 aa  95.9  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  30.89 
 
 
1199 aa  95.5  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  30.58 
 
 
1227 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  30.43 
 
 
1154 aa  95.9  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  29.56 
 
 
781 aa  95.1  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  29.58 
 
 
841 aa  94.4  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>