More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2964 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2964  cobalamin B12-binding domain-containing protein  100 
 
 		 223 aa  447  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0486605  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  39.18 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  37.75 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1835  cobalamin B12-binding domain protein  39.31 
 
 		 212 aa  132  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2368  cobalamin B12-binding domain protein  38.64 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  40.37 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0539  cobalamin B12-binding domain protein  34.45 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0720  cobalamin B12-binding domain protein  36.75 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  37.58 
 
 		 208 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  36.97 
 
 		 214 aa  123  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3886  cobalamin B12-binding domain protein  35.59 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000310147  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  36.75 
 
 		 251 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1311  cobalamin B12-binding  37.22 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.460326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2929  cobalamin B12-binding domain protein  32.87 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000012726  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  36.75 
 
 		 168 aa  118  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  38.2 
 
 		 207 aa  118  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  38.2 
 
 		 207 aa  117  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2567  cobalamin B12-binding domain protein  36.14 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474708  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  33.33 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  35.54 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.94 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1603  cobalamin B12-binding domain protein  35.59 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000910131  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  33.98 
 
 		 800 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2784  cobalamin B12-binding protein  31.55 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0108719  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  32.73 
 
 		 212 aa  113  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  33.51 
 
 		 801 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  35.54 
 
 		 219 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1605  cobalamin B12-binding domain protein  32.68 
 
 		 212 aa  112  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000212682  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  29.33 
 
 		 841 aa  112  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  37.5 
 
 		 804 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  35.33 
 
 		 807 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  37.13 
 
 		 802 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  35.29 
 
 		 804 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  31.82 
 
 		 804 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.76 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  32.49 
 
 		 607 aa  108  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1827  cobalamin B12-binding domain protein  32.37 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  30.92 
 
 		 214 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  34 
 
 		 813 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  34.5 
 
 		 811 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  31.25 
 
 		 804 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  36.31 
 
 		 818 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  32.82 
 
 		 804 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  30.65 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  33.33 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  33.53 
 
 		 768 aa  106  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1041  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.55 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.388992 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  30.24 
 
 		 217 aa  105  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  32.93 
 
 		 768 aa  104  9e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  36.31 
 
 		 804 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  32.26 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  35.62 
 
 		 820 aa  102  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  30.95 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  35.62 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  30.86 
 
 		 791 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  32.14 
 
 		 806 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3881  cobalamin B12-binding domain protein  32.6 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000148578  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  32.1 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  27.11 
 
 		 219 aa  99.4  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  30.73 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  32.18 
 
 		 841 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  32.75 
 
 		 839 aa  99  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  27.11 
 
 		 217 aa  98.6  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  28.71 
 
 		 793 aa  98.2  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  30.86 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  33.74 
 
 		 774 aa  96.7  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2571  cobalamin B12-binding domain protein  33.33 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.111371  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1107  cobalamin B12-binding domain protein  30.06 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4641  cobalamin B12-binding domain protein  32.43 
 
 		 213 aa  95.1  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0024  methyltransferase cognate corrinoid protein  35.33 
 
 		 220 aa  95.1  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0597  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 218 aa  95.1  8e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  27.14 
 
 		 780 aa  94.7  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1368  trimethylamine corrinoid protein  29.95 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000818926  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  36.09 
 
 		 803 aa  93.2  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  32.21 
 
 		 1195 aa  92.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2122  putative dimethylamine corrinoid protein  32.26 
 
 		 232 aa  92.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.154357  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  33.14 
 
 		 801 aa  92.8  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  27.08 
 
 		 781 aa  92.8  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0797  methionine synthase  32.26 
 
 		 232 aa  92.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.310628  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  29.9 
 
 		 1180 aa  92  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  31.15 
 
 		 1196 aa  92  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2310  trimethylamine corrinoid protein  33.12 
 
 		 216 aa  92  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00299987  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2550  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  32.69 
 
 		 235 aa  91.7  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  32.9 
 
 		 232 aa  91.7  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3658  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.21 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  29.46 
 
 		 1178 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1895  cobalamin B12-binding domain protein  30.06 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  30.41 
 
 		 816 aa  90.9  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0707  methionine synthase  33.33 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.784551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4611  cobalamin B12-binding domain protein  32.95 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.855843  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  26.89 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1470  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  31.61 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1267  methionine synthase  26.89 
 
 		 832 aa  89.4  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  31.41 
 
 		 259 aa  88.2  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  29.86 
 
 		 1173 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  30.39 
 
 		 1158 aa  88.2  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4337  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.32 
 
 		 326 aa  88.2  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.125438  normal  0.389787 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2387  B12-binding domain-containing protein  32.07 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  31.35 
 
 		 1254 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  29.96 
 
 		 1176 aa  87  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>