More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2571 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2571  cobalamin B12-binding domain protein  100 
 
 		 218 aa  446  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.111371  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1311  cobalamin B12-binding  44.33 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.460326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1605  cobalamin B12-binding domain protein  36.92 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000212682  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  37.8 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  37.32 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2567  cobalamin B12-binding domain protein  37.75 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474708  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  38.38 
 
 		 224 aa  137  8.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1835  cobalamin B12-binding domain protein  36.63 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1041  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.6 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.388992 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2929  cobalamin B12-binding domain protein  34.47 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000012726  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0720  cobalamin B12-binding domain protein  40 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3881  cobalamin B12-binding domain protein  34.31 
 
 		 216 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000148578  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  35.68 
 
 		 218 aa  121  7e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2368  cobalamin B12-binding domain protein  34.93 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0539  cobalamin B12-binding domain protein  38.69 
 
 		 218 aa  115  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3886  cobalamin B12-binding domain protein  33.49 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000310147  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1603  cobalamin B12-binding domain protein  34.12 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000910131  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  34.73 
 
 		 213 aa  111  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  35.2 
 
 		 768 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  36.36 
 
 		 607 aa  110  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  34.64 
 
 		 768 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  35.1 
 
 		 841 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  33.67 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  33.66 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  36.14 
 
 		 801 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3149  B12-dependent methionine synthase  34.34 
 
 		 1220 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  34.34 
 
 		 1264 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  34.22 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  34.22 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  34.34 
 
 		 1264 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2144  methionine synthase  35.2 
 
 		 1243 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.212238  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  35.29 
 
 		 819 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3053  B12-dependent methionine synthase  33.99 
 
 		 1251 aa  101  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.453999 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  34.33 
 
 		 1236 aa  101  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  30.81 
 
 		 1250 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  34.62 
 
 		 820 aa  101  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  35.93 
 
 		 839 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.09 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  37.14 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  33.01 
 
 		 804 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0973  B12-dependent methionine synthase  33.67 
 
 		 1244 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  32.54 
 
 		 818 aa  99.4  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1030  B12-dependent methionine synthase  33.67 
 
 		 1244 aa  99.4  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  32.69 
 
 		 801 aa  98.6  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0995  B12-dependent methionine synthase  33.67 
 
 		 1244 aa  98.6  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0391552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1007  B12-dependent methionine synthase  33.67 
 
 		 1244 aa  98.2  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  31.82 
 
 		 1136 aa  98.2  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  33.16 
 
 		 1251 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3368  B12-dependent methionine synthase  33.67 
 
 		 1233 aa  98.2  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2631  B12-dependent methionine synthase  32.65 
 
 		 1244 aa  98.2  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0960245  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0113  B12-dependent methionine synthase  32.45 
 
 		 1227 aa  98.2  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  32.04 
 
 		 1136 aa  98.2  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  32.95 
 
 		 774 aa  97.4  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  34.66 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  32.02 
 
 		 1225 aa  97.1  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  29.77 
 
 		 1267 aa  96.7  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0442  B12-dependent methionine synthase  32.11 
 
 		 1226 aa  97.1  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0758  B12-dependent methionine synthase  31.98 
 
 		 1246 aa  96.7  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.659122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  33.79 
 
 		 1228 aa  97.4  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2965  B12-dependent methionine synthase  34.44 
 
 		 1244 aa  96.3  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1510  methionine synthase  33.51 
 
 		 891 aa  96.3  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2964  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0486605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  30.05 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0710  B12-dependent methionine synthase  35 
 
 		 1240 aa  95.9  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  32.04 
 
 		 214 aa  95.5  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.67 
 
 		 1226 aa  95.5  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  33.33 
 
 		 1238 aa  95.1  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  32.58 
 
 		 1228 aa  95.1  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2612  methionine synthase  30.77 
 
 		 894 aa  95.1  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.268969 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  32.13 
 
 		 1245 aa  95.1  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  31.79 
 
 		 802 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.52 
 
 		 219 aa  94  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  37.72 
 
 		 804 aa  94.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  38.29 
 
 		 556 aa  94.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3775  B12-dependent methionine synthase  31.82 
 
 		 1227 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3618  methionine synthase (B12-dependent)  32.99 
 
 		 913 aa  94.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279732  hitchhiker  0.0036931 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  33.33 
 
 		 804 aa  94.4  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0838  B12-dependent methionine synthase  34.44 
 
 		 1244 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3184  B12-dependent methionine synthase  34.44 
 
 		 1244 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  34.44 
 
 		 1244 aa  94  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  32.47 
 
 		 251 aa  93.2  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  33.33 
 
 		 1245 aa  94  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.52 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3658  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.74 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3384  B12-dependent methionine synthase  33.67 
 
 		 1210 aa  93.2  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.73359  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2403  methionine synthase  32.98 
 
 		 894 aa  92.8  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362073  normal  0.0953455 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 219 aa  92.8  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0234  B12-dependent methionine synthase  32.77 
 
 		 1237 aa  92.8  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.545849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  31.37 
 
 		 800 aa  92.8  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0368  B12-dependent methionine synthase  31.84 
 
 		 1231 aa  92  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  36.76 
 
 		 210 aa  92.4  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0298  B12-dependent methionine synthase  32.46 
 
 		 1230 aa  92  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  30.5 
 
 		 1156 aa  92  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45056  B12 dependent methionine synthase  33 
 
 		 1252 aa  92.4  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00353368  normal  0.902557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0046  B12-dependent methionine synthase  31.62 
 
 		 1220 aa  92  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.61869 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  32.98 
 
 		 1226 aa  92  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3923  B12-dependent methionine synthase  31.84 
 
 		 1230 aa  92  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.54 
 
 		 216 aa  91.7  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  30.54 
 
 		 841 aa  91.7  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  29.5 
 
 		 210 aa  91.7  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>