More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1267 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  45.64 
 
 		 1208 aa  728    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1267  methionine synthase  100 
 
 		 832 aa  1703    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  45.52 
 
 		 1150 aa  708    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  44.93 
 
 		 1149 aa  668    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  45.94 
 
 		 1150 aa  707    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  45.43 
 
 		 1196 aa  729    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  44.69 
 
 		 1180 aa  692    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  45.7 
 
 		 1254 aa  732    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  44.61 
 
 		 1189 aa  688    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  45.52 
 
 		 1150 aa  708    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  38.06 
 
 		 1158 aa  543  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  37.77 
 
 		 1158 aa  531  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.44 
 
 		 1163 aa  526  1e-148  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  36.65 
 
 		 1154 aa  521  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  35.87 
 
 		 1156 aa  512  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  36.07 
 
 		 1154 aa  514  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  37.31 
 
 		 1169 aa  511  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  35.77 
 
 		 1178 aa  507  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  35.67 
 
 		 1157 aa  503  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  34.82 
 
 		 1223 aa  503  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  37.16 
 
 		 1176 aa  504  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  34.82 
 
 		 1195 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  35.75 
 
 		 1192 aa  501  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  36.55 
 
 		 1190 aa  496  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  36.04 
 
 		 1156 aa  498  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  34.05 
 
 		 1173 aa  498  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  35.41 
 
 		 1215 aa  493  9.999999999999999e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  35.35 
 
 		 1193 aa  491  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  34.78 
 
 		 1181 aa  491  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  37.53 
 
 		 1171 aa  491  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  35.1 
 
 		 1167 aa  487  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  35.26 
 
 		 1216 aa  483  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  34.83 
 
 		 1199 aa  481  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  35.7 
 
 		 1168 aa  482  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  34.19 
 
 		 1184 aa  479  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  35.1 
 
 		 1171 aa  479  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  34.22 
 
 		 1212 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  33.86 
 
 		 1178 aa  472  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  34.42 
 
 		 1136 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  33.26 
 
 		 1169 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  35.41 
 
 		 1182 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3349  methionine synthase  34.59 
 
 		 1214 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  34.93 
 
 		 1183 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  34.95 
 
 		 1136 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  34.12 
 
 		 1208 aa  465  1e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  34.29 
 
 		 1151 aa  464  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  33.6 
 
 		 1182 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  34.15 
 
 		 1132 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  33.26 
 
 		 1182 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  33 
 
 		 1197 aa  458  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  33.48 
 
 		 1176 aa  458  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  32.89 
 
 		 1214 aa  455  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  34.73 
 
 		 1132 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  34.38 
 
 		 1132 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  34.26 
 
 		 1132 aa  450  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  34.15 
 
 		 1132 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  34.38 
 
 		 1133 aa  451  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  34.38 
 
 		 1133 aa  451  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  34.8 
 
 		 1132 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  34.26 
 
 		 1132 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  34.26 
 
 		 1132 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  34.26 
 
 		 1132 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  32.75 
 
 		 1224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.96 
 
 		 1208 aa  444  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  33.6 
 
 		 1191 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  33.37 
 
 		 1191 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  33 
 
 		 1188 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  33.07 
 
 		 1188 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  33.07 
 
 		 1188 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  32.48 
 
 		 1191 aa  428  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  32.11 
 
 		 1187 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  29.01 
 
 		 1228 aa  323  6e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  30.14 
 
 		 1239 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2436  methionine synthase  29.5 
 
 		 885 aa  318  2e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0619597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  28.9 
 
 		 1266 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0283  B12-dependent methionine synthase  28.83 
 
 		 1290 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.383841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  28.67 
 
 		 1232 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  29.1 
 
 		 1250 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1848  methionine synthase (B12-dependent)  28.83 
 
 		 909 aa  308  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2671  methionine synthase  27.85 
 
 		 1269 aa  307  6e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2631  B12-dependent methionine synthase  28.85 
 
 		 1244 aa  305  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0960245  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0046  B12-dependent methionine synthase  28.56 
 
 		 1220 aa  304  5.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.61869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  28.76 
 
 		 1274 aa  303  8.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1123  B12-dependent methionine synthase  29.03 
 
 		 1246 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.833597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1764  B12-dependent methionine synthase  27.49 
 
 		 1304 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.075059  normal  0.0106397 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3618  methionine synthase (B12-dependent)  28.73 
 
 		 913 aa  302  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279732  hitchhiker  0.0036931 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  28.52 
 
 		 1230 aa  301  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  28 
 
 		 1245 aa  300  6e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  28.41 
 
 		 1278 aa  300  9e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0995  B12-dependent methionine synthase  28.47 
 
 		 1244 aa  300  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0391552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  28.46 
 
 		 1226 aa  299  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  28.91 
 
 		 1244 aa  299  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0973  B12-dependent methionine synthase  28.62 
 
 		 1244 aa  299  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2403  methionine synthase  29.12 
 
 		 894 aa  298  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362073  normal  0.0953455 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3206  methionine synthase (B12-dependent)  28.92 
 
 		 878 aa  298  3e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.336651  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1007  B12-dependent methionine synthase  28.62 
 
 		 1244 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3368  B12-dependent methionine synthase  28.62 
 
 		 1233 aa  297  4e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0838  B12-dependent methionine synthase  29.03 
 
 		 1244 aa  297  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  28.62 
 
 		 1226 aa  297  5e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3184  B12-dependent methionine synthase  29.03 
 
 		 1244 aa  297  5e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>