146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5849 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5849  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 
295 aa  574  1.0000000000000001e-163  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1373  transcriptional regulator, MerR family  51.65 
 
 
291 aa  246  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5847  transcriptional regulator, MerR family  40.25 
 
 
296 aa  135  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  26.28 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  28.27 
 
 
319 aa  79  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  28.69 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  45.08 
 
 
302 aa  68.9  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3169  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
315 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0340158  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  30.11 
 
 
319 aa  59.7  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.82 
 
 
305 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2740  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
295 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3013  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
295 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  45.9 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
299 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3801  transcriptional regulator, MerR family  27.34 
 
 
291 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000260127  hitchhiker  0.0000000000000558476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1544  transcriptional regulator, MerR family  27.21 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00914127  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1455  transcriptional regulator, MerR family  38 
 
 
142 aa  55.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1343  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
149 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2393  MerR family transcriptional regulator  38 
 
 
142 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161279  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41410  transcriptional regulatory protein, MerR-family  32.09 
 
 
314 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  46.67 
 
 
243 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  46.67 
 
 
243 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1370  MerR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
291 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000206673  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  46.67 
 
 
243 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2852  MerR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
130 aa  53.5  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.164617  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3096  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
140 aa  53.5  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  46.67 
 
 
243 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
243 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  46.67 
 
 
243 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2350  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
243 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749654  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1399  MerR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
292 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147582  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1371  MerR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
292 aa  53.1  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000540169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1650  transcriptional regulator, MerR family  25.74 
 
 
291 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1509  MerR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
291 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000195029  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
243 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1583  transcriptional regulator, MerR family  25.74 
 
 
291 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53357e-31 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
243 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  46.67 
 
 
243 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2399  transcriptional regulator, MerR family protein  46.67 
 
 
243 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
243 aa  52.8  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3212  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
335 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645977  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
321 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
311 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1614  MerR family transcriptional regulator  24.52 
 
 
169 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1308  transcriptional regulator, MerR family  30.83 
 
 
342 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
305 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05121  hypothetical protein  31.78 
 
 
267 aa  52  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2109  MerR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
159 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.208629  normal  0.127157 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1164  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3567  transcriptional regulator, MerR family  46.03 
 
 
389 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3055  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
342 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3069  MerR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4609  MerR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
136 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.401376  normal  0.0601167 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1411  MerR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000846806  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
319 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  48.94 
 
 
282 aa  50.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4449  MerR family transcriptional regulator  28.88 
 
 
293 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1877  transcriptional regulator, MerR family  32.26 
 
 
159 aa  49.7  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1752  MerR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
161 aa  49.7  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0206721 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  34.17 
 
 
324 aa  49.7  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  40.38 
 
 
243 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.38 
 
 
243 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  40.38 
 
 
243 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
303 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  40.38 
 
 
243 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  40.38 
 
 
243 aa  49.3  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
245 aa  49.3  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  40.38 
 
 
243 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  40.38 
 
 
243 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
243 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1235  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
366 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2715  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
326 aa  49.3  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1167  MerR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
144 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354578  normal  0.670626 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1155  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
317 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  32.05 
 
 
299 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0781  MerR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
299 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818873  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1165  MerR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
352 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2301  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
122 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1551  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
132 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.724017  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1282  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
143 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1503  MerR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
242 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104173 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001251  transcriptional regulator MerR family  24.24 
 
 
267 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1781  transcriptional regulator, MerR family protein  40.68 
 
 
242 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.329966  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0081  MerR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
265 aa  47.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00994643  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2835  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
97 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0730655  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
310 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0740  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
299 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
345 aa  47  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2670  regulatory protein, MerR  35.62 
 
 
125 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4735  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
313 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1488  transcriptional regulator, MerR family protein  40.68 
 
 
242 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.372841  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1640  transcriptional regulator, MerR family  29.91 
 
 
143 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402978  normal  0.373133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0768  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
299 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  28.67 
 
 
311 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>