223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2670 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2670  regulatory protein, MerR  100 
 
 		 125 aa  254  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1996  MerR family transcriptional regulator  93.98 
 
 		 141 aa  168  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000181748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1282  MerR family transcriptional regulator  68.8 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1970  transcriptional regulator, MerR family  62.96 
 
 		 143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.858434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1551  MerR family transcriptional regulator  69.67 
 
 		 132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.724017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1640  transcriptional regulator, MerR family  63.7 
 
 		 143 aa  164  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402978  normal  0.373133 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1406  MerR family transcriptional regulator  79.8 
 
 		 137 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1772  MerR family transcriptional regulator  86.21 
 
 		 136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328935  normal  0.318397 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1167  MerR family transcriptional regulator  64.89 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354578  normal  0.670626 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1000  MerR family transcriptional regulator  86.21 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.861508  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1459  MerR family transcriptional regulator  86.21 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3018  transcriptional regulator, MerR family  66.94 
 
 		 126 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438934  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1482  MerR family transcriptional regulator  86.21 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.858746  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4622  MerR family transcriptional regulator  69.3 
 
 		 137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206932  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2588  MerR family transcriptional regulator  81.05 
 
 		 134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1366  MerR family transcriptional regulator  67.46 
 
 		 137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1719  MerR family transcriptional regulator  90.24 
 
 		 134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1089  MerR family transcriptional regulator  90.24 
 
 		 134 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1898  MerR family regulatory protein  90.24 
 
 		 134 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1378  MerR family transcriptional regulator  66.14 
 
 		 137 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0815083  normal  0.541754 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1532  MerR family transcriptional regulator  90.24 
 
 		 134 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.591284  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1881  putative transcriptional regulator  72.57 
 
 		 157 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.027165 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0196  MerR family transcriptional regulator  90.24 
 
 		 134 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1742  MerR family transcriptional regulator  90.24 
 
 		 134 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0970  MerR family transcriptional regulator  81.05 
 
 		 126 aa  160  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1584  putative transcription regulator protein  92.41 
 
 		 146 aa  159  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2852  MerR family transcriptional regulator  64.8 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.164617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2749  transcriptional regulator, MerR family  93.59 
 
 		 137 aa  158  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0494  MerR family transcriptional regulator  66.39 
 
 		 121 aa  158  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0739492  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2109  MerR family transcriptional regulator  87.34 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.208629  normal  0.127157 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1455  transcriptional regulator, MerR family  88.61 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2393  MerR family transcriptional regulator  88.61 
 
 		 142 aa  157  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3096  MerR family transcriptional regulator  77.17 
 
 		 140 aa  157  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1014  MerR family transcriptional regulator  69.03 
 
 		 121 aa  156  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986669 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1752  MerR family transcriptional regulator  76.84 
 
 		 161 aa  154  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0206721 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1877  transcriptional regulator, MerR family  86.08 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4609  MerR family transcriptional regulator  80 
 
 		 136 aa  149  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.401376  normal  0.0601167 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0836  MerR family transcriptional regulator  79.52 
 
 		 116 aa  149  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1343  MerR family transcriptional regulator  73.12 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0761  MerR family transcriptional regulator  60.5 
 
 		 118 aa  146  9e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0874748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3474  MerR family transcriptional regulator  69.7 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283655 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2472  hypothetical protein  69.7 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3218  MerR family transcriptional regulator  69.7 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330484 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2847  MerR family transcriptional regulator  76.47 
 
 		 162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.786709  hitchhiker  0.005225 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0434  MerR family transcriptional regulator  60.16 
 
 		 120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2798  transcriptional regulator, MerR family  61.21 
 
 		 118 aa  143  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1147  MerR family transcriptional regulator  59.66 
 
 		 118 aa  143  9e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0571667  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1974  MerR family transcriptional regulator  68.69 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01390  transcription regulator protein  61.95 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249906  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2169  regulatory protein, MerR  73.91 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2511  hypothetical protein  74.16 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28730  putative transcriptional regulator  74.16 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000134436  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1584  MerR family transcriptional regulator  71.13 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2385  transcriptional regulator, putative  73.91 
 
 		 118 aa  140  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170009  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1983  MerR family transcriptional regulator  74.16 
 
 		 118 aa  140  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00884217  normal  0.359201 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1938  MerR family transcriptional regulator  74.16 
 
 		 118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1457  transcriptional regulator, MerR family  71.43 
 
 		 118 aa  137  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0919  transcriptional regulator, MerR family  55.17 
 
 		 118 aa  130  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2054  MerR family transcriptional regulator  52.03 
 
 		 121 aa  130  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1313  transcriptional regulator, MerR family  75.32 
 
 		 173 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1471  transcriptional regulator domain-containing protein  56.88 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2092  MerR family transcriptional regulator  63.92 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.681298  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2013  MerR family transcriptional regulator  61 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065719  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1408  transcriptional regulator, MerR family  56.88 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00332069  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2236  transcriptional regulator, MerR family  70.13 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2607  transcriptional regulator, MerR family  70.13 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1660  MerR family transcriptional regulator  55.66 
 
 		 129 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3741  transcriptional regulator, MerR family  45.95 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274926  normal  0.767741 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1425  transcriptional regulator  50 
 
 		 116 aa  99.4  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000104332  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1669  MerR family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 241 aa  87.8  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3922  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.856583  normal  0.167239 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1416  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0849625  normal  0.242004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2301  MerR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 122 aa  83.6  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6232  MerR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2331  transcriptional regulator, MerR family  39.83 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2056  regulatory protein MerR  39.83 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.880106  normal  0.300945 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0640  MerR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7073  transcriptional regulator, MerR family  44.79 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2621  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361193  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0267  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1148  MerR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3558  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1522  transcriptional regulator, putative  45.12 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0919543  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2017  transcriptional regulator, MerR family  47.67 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1914  MerR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.346124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3038  MerR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0025515  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0831  MerR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.087298  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3295  transcriptional regulator, MerR family  46.43 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987974  normal  0.206317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1199  transcriptional regulator, MerR family  43.18 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2652  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00282985  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2678  MerR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00961924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1288  transcriptional regulator, MerR family  43.18 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1889  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000504717  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4387  MerR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 757 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0650  transcriptional regulator, MerR family  42.55 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00809015 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2925  MerR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00455933  hitchhiker  0.00151967 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0772  hypothetical protein  43.18 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2516  MerR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3022  transcriptional regulator, MerR family  40.2 
 
 		 250 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1409  MerR family transcriptional regulator  38 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.783915  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>