95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4437 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4437  regulatory protein, MerR  100 
 
 		 314 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.889782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4927  MerR family transcriptional regulator  85.99 
 
 		 314 aa  486  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6541  transcriptional regulator, MerR family  43.18 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0915123  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1612  putative transcriptional regulator, MerR family  40.83 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1817  transcriptional regulator, MerR family  43.69 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3567  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 389 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3056  transcriptional regulator, MerR family  47.1 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2587  transcriptional regulator, MerR family  61.18 
 
 		 354 aa  96.3  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.366635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0686  transcriptional regulator, MerR family  44.38 
 
 		 363 aa  93.2  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.162378  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0738  putative transcriptional regulator, MerR family  70.69 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.878352  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  26.29 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0637  transcriptional regulator, MerR family  57.14 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  27.17 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28680  predicted transcriptional regulator  64.91 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  26.4 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  26.19 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  25.31 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.19 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  27.08 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0370  regulatory protein MerR  30.04 
 
 		 304 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3717  regulatory protein MerR  23.2 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 245 aa  55.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1049  transcriptional regulator, MerR family  26.72 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362937  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  43.86 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  43.86 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  43.86 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  43.86 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  43.86 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  43.86 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1384  transcriptional regulator, MerR family  20.32 
 
 		 298 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000396773  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  43.86 
 
 		 243 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3692  MerR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1448  MerR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2972  MerR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 316 aa  50.1  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0234999  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2032  MerR family transcriptional regulator  21.01 
 
 		 295 aa  49.7  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.662057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2399  transcriptional regulator, MerR family  27.12 
 
 		 316 aa  49.7  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4299  regulatory protein MerR  26.32 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0130356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2740  MerR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  37.18 
 
 		 152 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41410  transcriptional regulatory protein, MerR-family  30.66 
 
 		 314 aa  47.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3013  MerR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 295 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 320 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0487  regulatory protein, MerR  26.16 
 
 		 301 aa  46.2  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2399  transcriptional regulator, MerR family protein  34.92 
 
 		 243 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  34.92 
 
 		 243 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1060  MerR family transcriptional regulator  21.32 
 
 		 300 aa  45.8  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  34.92 
 
 		 243 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  34.92 
 
 		 243 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  34.92 
 
 		 243 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 243 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  34.92 
 
 		 243 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  41.1 
 
 		 449 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  35.53 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0675  cobalamin B12-binding domain protein  34.07 
 
 		 224 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000394435  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1165  MerR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 243 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1164  MerR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  44.68 
 
 		 241 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  34.92 
 
 		 243 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3758  MerR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 349 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.312823 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 243 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2350  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 243 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4920  cobalamin B12-binding domain protein  32.73 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230842  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3335  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.65 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1235  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3324  cobalamin B12-binding protein  30.65 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3386  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.65 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0329482 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0525  putative transcriptional regulator, MerR family  30.95 
 
 		 147 aa  43.5  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178502 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 395 aa  43.5  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 251 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 243 aa  43.1  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4396  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 342 aa  43.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 135 aa  42.7  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1155  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 317 aa  42.7  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1189  MerR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 156 aa  43.1  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  43.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 253 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 345 aa  42.7  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3169  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 315 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0340158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4735  MerR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 313 aa  42.7  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.49506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>