80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4927 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4927  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 314 aa  595  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4437  regulatory protein, MerR  85.99 
 
 		 314 aa  430  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.889782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6541  transcriptional regulator, MerR family  43.17 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0915123  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1817  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1612  putative transcriptional regulator, MerR family  39.82 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3567  transcriptional regulator, MerR family  42.93 
 
 		 389 aa  123  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3056  transcriptional regulator, MerR family  38.57 
 
 		 344 aa  95.5  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247137 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0686  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 363 aa  90.9  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.162378  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2587  transcriptional regulator, MerR family  67.61 
 
 		 354 aa  90.5  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.366635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0738  putative transcriptional regulator, MerR family  68.97 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.878352  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  26.38 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0637  transcriptional regulator, MerR family  55.56 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28680  predicted transcriptional regulator  63.79 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  26.69 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  26.4 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  27.67 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  27.17 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.77 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1049  transcriptional regulator, MerR family  28.81 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362937  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0370  regulatory protein MerR  31.36 
 
 		 304 aa  57  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 245 aa  53.9  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2032  MerR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 295 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.662057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  25.82 
 
 		 324 aa  52.8  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  42.11 
 
 		 243 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  42.11 
 
 		 243 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  42.11 
 
 		 243 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  42.11 
 
 		 243 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  42.11 
 
 		 243 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 243 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  42.11 
 
 		 243 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  42.11 
 
 		 243 aa  50.8  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3692  MerR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3324  cobalamin B12-binding protein  33.33 
 
 		 360 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3335  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 360 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3386  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 360 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0329482 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  27 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2972  MerR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0234999  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1384  transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000396773  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0487  regulatory protein, MerR  27.2 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2399  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 316 aa  46.6  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 253 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1448  MerR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3758  MerR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 349 aa  46.2  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.312823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1165  MerR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 352 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  26.54 
 
 		 322 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1235  MerR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 366 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 254 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 254 aa  45.8  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 254 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 253 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1164  MerR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 361 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 253 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0978  response regulator receiver protein  20.71 
 
 		 280 aa  44.3  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  40.85 
 
 		 449 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4920  cobalamin B12-binding domain protein  33.04 
 
 		 366 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230842  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  33.33 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2399  transcriptional regulator, MerR family protein  33.33 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  33.33 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2350  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  33.33 
 
 		 243 aa  43.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1373  transcriptional regulator, MerR family  44.9 
 
 		 291 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  44.44 
 
 		 241 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3717  regulatory protein MerR  22.67 
 
 		 315 aa  42.7  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3013  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 295 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  29.69 
 
 		 395 aa  42.4  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2740  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 295 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>