105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28680 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_28680  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 438 aa  856    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0686  transcriptional regulator, MerR family  49.01 
 
 		 363 aa  288  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.162378  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0637  transcriptional regulator, MerR family  38.61 
 
 		 399 aa  232  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2587  transcriptional regulator, MerR family  77.33 
 
 		 354 aa  117  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.366635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0738  putative transcriptional regulator, MerR family  87.93 
 
 		 356 aa  104  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.878352  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3056  transcriptional regulator, MerR family  63.86 
 
 		 344 aa  99.8  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247137 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4927  MerR family transcriptional regulator  65.22 
 
 		 314 aa  86.7  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6541  transcriptional regulator, MerR family  56.96 
 
 		 309 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0915123  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4437  regulatory protein, MerR  66.1 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.889782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1612  putative transcriptional regulator, MerR family  49.43 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3567  transcriptional regulator, MerR family  57.97 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.1 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  38.1 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  38.1 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  38.1 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  38.1 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  36.9 
 
 		 243 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  37.89 
 
 		 293 aa  54.7  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  42.86 
 
 		 319 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1049  transcriptional regulator, MerR family  43.94 
 
 		 304 aa  54.7  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362937  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  42.86 
 
 		 319 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4299  regulatory protein MerR  34.45 
 
 		 337 aa  53.5  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0130356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  30.71 
 
 		 324 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41410  transcriptional regulatory protein, MerR-family  44.12 
 
 		 314 aa  50.8  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 298 aa  50.4  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 319 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4449  MerR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 293 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18780  predicted transcriptional regulator  33.03 
 
 		 183 aa  50.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  36.47 
 
 		 305 aa  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2972  MerR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 316 aa  49.7  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0234999  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0238  hypothetical protein  44.44 
 
 		 320 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2399  transcriptional regulator, MerR family  42.62 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 322 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0740  MerR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 299 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0487  regulatory protein, MerR  37.5 
 
 		 301 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 320 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0768  MerR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1155  MerR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 317 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1384  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 298 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000396773  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  36.36 
 
 		 315 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0781  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 299 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1503  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 242 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104173 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1525  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 242 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175945 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  37.29 
 
 		 241 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1488  transcriptional regulator, MerR family protein  34.29 
 
 		 242 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.372841  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1781  transcriptional regulator, MerR family protein  34.29 
 
 		 242 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.329966  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  29.7 
 
 		 253 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4735  MerR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 313 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 292 aa  47.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1577  transcriptional regulator, MerR family  38.6 
 
 		 343 aa  47.4  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  42.37 
 
 		 302 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0962  regulatory protein, MerR  42.37 
 
 		 300 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 253 aa  47.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  29 
 
 		 251 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 342 aa  47  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3758  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 349 aa  46.6  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.312823 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0822  transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 327 aa  46.6  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.528612  normal  0.372171 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 282 aa  46.2  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 305 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0064  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 242 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  35.14 
 
 		 299 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  41.51 
 
 		 131 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  32.93 
 
 		 243 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  32.93 
 
 		 243 aa  45.8  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 302 aa  45.8  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  32.93 
 
 		 243 aa  45.8  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 243 aa  45.8  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  32.1 
 
 		 243 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  37.31 
 
 		 319 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  32.93 
 
 		 243 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0370  regulatory protein MerR  40.98 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  31.88 
 
 		 318 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 321 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2350  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 243 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 243 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2399  transcriptional regulator, MerR family protein  29.41 
 
 		 243 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  29.41 
 
 		 243 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 243 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2740  MerR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 295 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1448  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 319 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3013  MerR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 295 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  30.11 
 
 		 183 aa  44.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  33.72 
 
 		 449 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0230  MerR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 169 aa  44.3  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.279469 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  27.72 
 
 		 253 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 254 aa  43.5  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 254 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 302 aa  43.5  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  28.26 
 
 		 125 aa  43.5  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  27.72 
 
 		 253 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 254 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  28.83 
 
 		 125 aa  43.5  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  32.38 
 
 		 157 aa  43.5  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  36.36 
 
 		 134 aa  43.5  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0766  putative heat shock protein HspR  29.21 
 
 		 123 aa  43.1  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>