More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0186 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0186  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 452 aa  936    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  46.15 
 
 		 284 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  27.1 
 
 		 284 aa  97.4  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 281 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  43.4 
 
 		 281 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  27.03 
 
 		 286 aa  94  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  43.27 
 
 		 290 aa  94  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 290 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  41.51 
 
 		 281 aa  94  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  41.51 
 
 		 281 aa  94  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3564  transcriptional regulator, AraC family  41.44 
 
 		 285 aa  93.6  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  44.34 
 
 		 300 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 300 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 300 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 300 aa  92.8  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 300 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 300 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 300 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  44.34 
 
 		 300 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  44.34 
 
 		 300 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  44.34 
 
 		 300 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  41.44 
 
 		 287 aa  91.3  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 290 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  41.9 
 
 		 129 aa  91.3  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3138  AraC family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 281 aa  90.5  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 290 aa  90.1  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 290 aa  90.1  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  41.35 
 
 		 290 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  39.64 
 
 		 285 aa  89.7  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  26.51 
 
 		 288 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  39.82 
 
 		 281 aa  88.6  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 289 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 280 aa  88.6  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  26.51 
 
 		 288 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  41.35 
 
 		 290 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 292 aa  88.2  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  26.17 
 
 		 288 aa  87.8  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 290 aa  87.4  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2556  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  87.4  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000235949  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0076  transcription activator, effector binding  24.57 
 
 		 288 aa  87  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3142  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 301 aa  86.7  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3181  AraC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 292 aa  86.7  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1398  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 296 aa  86.7  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  39.42 
 
 		 290 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0137  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 315 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.10009 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  25.68 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  25.94 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  26.84 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  26.96 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  38.39 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 288 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3564  AraC family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 279 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0674  AraC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 265 aa  82  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2173  AraC family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3013  transcription activator, effector binding  24.48 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3049  MerR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  37.39 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0371  AraC family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1798  transcriptional regulator, AraC family  36.17 
 
 		 200 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1802  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0077  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  24.83 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4381  transcription activator effector binding  25.08 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0028  transcriptional regulator, AraC family  25.09 
 
 		 279 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 306 aa  75.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1644  transcriptional regulator, AraC family  27.05 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930139  normal  0.386203 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2780  transcriptional regulator, AraC family  30.84 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0531003  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0034  transcriptional regulator, AraC family  25.17 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.255751 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03630  transcription activator effector binding  33.12 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000171758  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1523  AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 152 aa  74.3  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00364512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4660  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  35.85 
 
 		 107 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4610  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  35.85 
 
 		 107 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0547666  normal  0.902957 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4524  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  35.85 
 
 		 107 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4609  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  35.85 
 
 		 107 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.917171  normal  0.375209 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4516  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  35.85 
 
 		 107 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4566  transcriptional regulator, AraC family  26.07 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2251  transcriptional regulator, AraC family  35.19 
 
 		 287 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00257  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37 
 
 		 283 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3303  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 228 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 326 aa  72.4  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0352  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 285 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203769  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0313  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 285 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3321  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 283 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000611  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  25.09 
 
 		 289 aa  72  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0208776  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3481  right origin-binding protein  25.61 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0814  right origin-binding protein  25.61 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0268  putative HTH-type transcriptional regulator YkgA  37 
 
 		 163 aa  71.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>