More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3049 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3049  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 335 aa  689    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0114  transcriptional regulator, MerR family  46.22 
 
 		 329 aa  291  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000486675  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3186  transcriptional regulator, MerR family  45.43 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2778  transcriptional regulator, MerR family  29.88 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.779446  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03630  transcription activator effector binding  29.41 
 
 		 231 aa  99  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000171758  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2039  MerR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 306 aa  86.7  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00422777  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0186  transcriptional regulator, AraC family  33.52 
 
 		 452 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3713  MerR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000895581  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  31.4 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  33.94 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  32.41 
 
 		 254 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  32.46 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  27.34 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  32.11 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  41.1 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1915  MerR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 136 aa  60.5  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  34.26 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  23.44 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.04 
 
 		 134 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 254 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  33.04 
 
 		 138 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  36.62 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  31.97 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 134 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  30.84 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 253 aa  57  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 342 aa  57  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  30.43 
 
 		 137 aa  57  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 		 254 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.03 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 260 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  33.33 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  33.04 
 
 		 132 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.41 
 
 		 142 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 153 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  26.13 
 
 		 262 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 155 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  33.6 
 
 		 139 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  32.41 
 
 		 140 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  36.19 
 
 		 142 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 258 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3566  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 147 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  29.52 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 139 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  40.38 
 
 		 155 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  34.09 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  26.95 
 
 		 253 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 253 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0411  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 169 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.715886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  29.79 
 
 		 259 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  33.64 
 
 		 133 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  30.7 
 
 		 251 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.82 
 
 		 134 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 343 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 276 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 131 aa  53.9  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 155 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 138 aa  54.3  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 134 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 134 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  33.72 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  32.41 
 
 		 142 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 134 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.82 
 
 		 134 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  43.28 
 
 		 336 aa  53.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 140 aa  53.9  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 648 aa  53.9  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 141 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 343 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1400  MerR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 161 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 251 aa  53.5  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  23.68 
 
 		 242 aa  53.5  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3014  MerR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 195 aa  53.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.37376 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  28.68 
 
 		 342 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3016  MerR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 277 aa  53.1  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684201  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 254 aa  53.5  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 254 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 253 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 253 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 253 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>