More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2759 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 292 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  68.97 
 
 		 290 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  69.66 
 
 		 290 aa  429  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  68.97 
 
 		 290 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  68.97 
 
 		 290 aa  428  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  67.93 
 
 		 290 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  68.62 
 
 		 290 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  67.24 
 
 		 290 aa  421  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  66.9 
 
 		 290 aa  422  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  67.59 
 
 		 290 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  66.55 
 
 		 290 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  56.75 
 
 		 291 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  53.95 
 
 		 291 aa  355  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 280 aa  292  4e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1802  transcriptional regulator, AraC family  44.95 
 
 		 286 aa  261  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1266  AraC family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.23796  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2251  transcriptional regulator, AraC family  43.25 
 
 		 287 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2780  transcriptional regulator, AraC family  40.7 
 
 		 285 aa  234  9e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0531003  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  44.52 
 
 		 281 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  44.19 
 
 		 281 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  44.97 
 
 		 281 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 281 aa  222  6e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  39.09 
 
 		 287 aa  222  6e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2127  transcription activator effector binding protein  41.98 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  42.72 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0329  transcription activator effector binding protein  36.33 
 
 		 288 aa  216  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0236652  normal  0.0105288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1127  transcriptional regulator, AraC family  37.11 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  40.4 
 
 		 289 aa  209  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  40.96 
 
 		 287 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3181  AraC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 313 aa  201  9e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3138  AraC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 281 aa  199  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3564  transcriptional regulator, AraC family  36.6 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0137  AraC family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 315 aa  195  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.10009 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3142  AraC family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3344  helix-turn-helix domain-containing protein  43.68 
 
 		 232 aa  192  8e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.388455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2556  AraC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 290 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000235949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  32.55 
 
 		 285 aa  162  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  34.13 
 
 		 282 aa  162  9e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 280 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  31.85 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1798  transcriptional regulator, AraC family  43.54 
 
 		 200 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0674  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  29.1 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 300 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  29.33 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0086  transcriptional regulator, AraC family  32.41 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.353006  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  26.96 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1069  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.689445  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  29.35 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  25.48 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1563  transcription activator, effector binding  25.6 
 
 		 297 aa  96.3  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1594  transcription activator effector binding  25.6 
 
 		 297 aa  96.3  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.630007  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  26.48 
 
 		 314 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  25.6 
 
 		 279 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  26.33 
 
 		 279 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1353  transcription activator effector binding  32.32 
 
 		 160 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.266351  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  24.83 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  27.93 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  26.3 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  25.76 
 
 		 296 aa  89  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0186  transcriptional regulator, AraC family  38.74 
 
 		 452 aa  88.2  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  25.25 
 
 		 310 aa  87  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  25.1 
 
 		 283 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  24.13 
 
 		 277 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  25.25 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0910  HTH-type transcription regulator, AraC-family  24.41 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576456  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  25.25 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4381  transcription activator effector binding  26.33 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  39.05 
 
 		 129 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  39.8 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  38.78 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0076  transcription activator, effector binding  27.31 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>