More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1790 on replicon NC_013164
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 282 aa  571  1.0000000000000001e-162  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1798  transcriptional regulator, AraC family  95.48 
 
 		 200 aa  382  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 280 aa  317  1e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  50.18 
 
 		 281 aa  313  2.9999999999999996e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  34.13 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  33.56 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  33.79 
 
 		 290 aa  172  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 290 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 290 aa  169  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 287 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3564  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 285 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 292 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3138  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 281 aa  159  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  33.89 
 
 		 289 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C09  transcription activator effector binding domain-containing protein  46.79 
 
 		 154 aa  154  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 281 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3181  AraC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 292 aa  142  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  34.56 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  33.22 
 
 		 281 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  33.56 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  29.53 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  30.07 
 
 		 287 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0058  hypothetical protein  53.57 
 
 		 110 aa  138  8.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  30.72 
 
 		 284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 285 aa  135  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  29.39 
 
 		 291 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3142  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  29.29 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1802  transcriptional regulator, AraC family  28.81 
 
 		 286 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  29.29 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 300 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 300 aa  132  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 300 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  29.29 
 
 		 300 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2251  transcriptional regulator, AraC family  31.49 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0329  transcription activator effector binding protein  25.78 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0236652  normal  0.0105288 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  30.1 
 
 		 302 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2556  AraC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000235949  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1127  transcriptional regulator, AraC family  24.74 
 
 		 288 aa  116  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  28.97 
 
 		 279 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0137  AraC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.10009 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2780  transcriptional regulator, AraC family  26.57 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0531003  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0086  transcriptional regulator, AraC family  27.3 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.353006  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1266  AraC family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.23796  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  25.41 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3344  helix-turn-helix domain-containing protein  31.72 
 
 		 232 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.388455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  28.52 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 277 aa  99  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  28.23 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  24.92 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 281 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2127  transcription activator effector binding protein  26.03 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0674  AraC family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 265 aa  93.6  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  26.04 
 
 		 310 aa  91.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1069  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.689445  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  26.19 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3482  AraC family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 140 aa  89  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0910  HTH-type transcription regulator, AraC-family  24.58 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  37.29 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  37.29 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1563  transcription activator, effector binding  26.99 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1594  transcription activator effector binding  26.99 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.630007  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0186  transcriptional regulator, AraC family  37.39 
 
 		 452 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1078  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 113 aa  77.8  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.531138 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  25.19 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  23.16 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1931  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0129269  hitchhiker  0.0018191 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0423  hypothetical protein  35.56 
 
 		 132 aa  75.1  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0620  transposon Tn10 TetD protein  38.95 
 
 		 113 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  24.39 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0677  transposon Tn10 TetD protein  38.95 
 
 		 113 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0739  transposon Tn10 TetD protein  38.95 
 
 		 113 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  24.39 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  24.39 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  21.91 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2755  transcriptional regulator, AraC family  33.63 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0634  transposon Tn10 TetD protein  38.95 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>