More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2778 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2778  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 305 aa  615  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.779446  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3186  transcriptional regulator, MerR family  31.46 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3049  MerR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 335 aa  143  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0114  transcriptional regulator, MerR family  28.53 
 
 		 329 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000486675  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03630  transcription activator effector binding  37.25 
 
 		 231 aa  122  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000171758  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2039  MerR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00422777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3713  MerR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000895581  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0019  transcription activator effector binding  35.07 
 
 		 176 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.833859  normal  0.221599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  23.97 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0186  transcriptional regulator, AraC family  29.88 
 
 		 452 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  34.29 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  41 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  29.46 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4735  transcriptional regulator, MerR family  55.77 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  48.08 
 
 		 124 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 145 aa  57  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2889  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359034  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  51.79 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1535  MerR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.139036  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  38 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  39 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0743  MerR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  34.68 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 188 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  36.46 
 
 		 148 aa  55.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 154 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0923  MerR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 119 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190958  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  43.94 
 
 		 140 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  38.75 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4449  mercuric resistance operon regulatory protein  38.1 
 
 		 119 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00937003  normal  0.868186 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0886  mercuric resistance operon regulatory protein  38.1 
 
 		 119 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3033  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 133 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0661406  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  26.79 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  30.97 
 
 		 273 aa  54.3  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  38.75 
 
 		 276 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 183 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  35.14 
 
 		 112 aa  53.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 125 aa  53.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 125 aa  53.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  29.66 
 
 		 145 aa  53.1  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7954  putative transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 119 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 270 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 276 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 276 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  21.63 
 
 		 272 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  29.46 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1130  MerR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 140 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0762  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 110 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358018  normal  0.111351 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 158 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  35.21 
 
 		 137 aa  52  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 155 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 179 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 113 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1657  transcriptional regulator, MerR family  28.42 
 
 		 272 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 138 aa  52  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  30.3 
 
 		 170 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  30.56 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 163 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 166 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  30.56 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  36.47 
 
 		 270 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 133 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  38.98 
 
 		 138 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 267 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  30.56 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 182 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 132 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  30.56 
 
 		 243 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  30.56 
 
 		 243 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 132 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  24.53 
 
 		 273 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  26.44 
 
 		 169 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 343 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  31.48 
 
 		 244 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  35.82 
 
 		 253 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 122 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 303 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  30.56 
 
 		 244 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30.91 
 
 		 135 aa  49.7  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 166 aa  50.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 166 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 119 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 113 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  46.94 
 
 		 147 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 122 aa  50.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 132 aa  50.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 146 aa  49.7  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 125 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  30.56 
 
 		 243 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>